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Opening the Black Box: Interpretable Machine Learning for Geneticists
Trends in genetics, 2020-06, Vol.36 (6), p.442-455
2020
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Benchmarking Parametric and Machine Learning Models for Genomic Prediction of Complex Traits
G3 : genes - genomes - genetics, 2019-11, Vol.9 (11), p.3691-3702
2019
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Transcriptome-Based Prediction of Complex Traits in Maize
The Plant cell, 2020, Vol.32 (1), p.139-151
2020
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Putative cis-Regulatory Elements Predict Iron Deficiency Responses in Arabidopsis Roots
Plant physiology (Bethesda), 2020-03, Vol.182 (3), p.1420-1439
2020
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splatPop: simulating population scale single-cell RNA sequencing data
Genome Biology, 2021-12, Vol.22 (1), p.341-341, Article 341
2021
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Optimizing expression quantitative trait locus mapping workflows for single-cell studies
Genome Biology, 2021-06, Vol.22 (1), p.188-188, Article 188
2021
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Perceptions of emerging biotechnologies
Environmental research letters, 2019-11, Vol.14 (11), p.114018
2019
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Evolutionarily conserved hierarchical gene regulatory networks for plant salt stress response
Nature plants, 2021-06, Vol.7 (6), p.787
2021
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Expression and regulatory asymmetry of retained Arabidopsis thaliana transcription factor genes derived from whole genome duplication
BMC ecology and evolution, 2019-03, Vol.19 (1), p.77
2019
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Evolutionary characteristics of intergenic transcribed regions indicate rare novel genes and widespread noisy transcription in the Poaceae
Scientific reports, 2019-08, Vol.9 (1), p.12122-14, Article 12122
2019
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Cis-Regulatory Code for Predicting Plant Cell-Type Transcriptional Response to High Salinity
Plant physiology (Bethesda), 2019-12, Vol.181 (4), p.1739-1751
2019
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Predictive Models of Spatial Transcriptional Response to High Salinity
Plant physiology (Bethesda), 2017-05, Vol.174 (1), p.450-464
2017
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Cell-type-specific and disease-associated expression quantitative trait loci in the human lung
Nature genetics, 2024-04, Vol.56 (4), p.595-604
2024
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Author Correction: Cell-type-specific and disease-associated expression quantitative trait loci in the human lung
Nature genetics, 2024-05, Vol.56 (5), p.1034-1034
2024
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Genetic models reveal historical patterns of sea lamprey population fluctuations within Lake Champlain
PeerJ (San Francisco, CA), 2015-10, Vol.3, p.e1369-e1369, Article e1369
2015
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Cis-Regulatory Code for Predicting Plant Cell-Type Transcriptional Response to High Salinity
Plant physiology (Bethesda), 2019-12, Vol.181 (4)
2019
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Opening the Black Box: Interpretable Machine Learning for Geneticists
Trends in genetics, 2020-06, Vol.36 (6)
2020
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Putative cis-Regulatory Elements Predict Iron Deficiency Responses in Arabidopsis Roots
Plant physiology (Bethesda), 2020-01, Vol.182 (3)
2020
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Putative cis-Regulatory Elements Predict Iron Deficiency Responses in Arabidopsis Roots1[OPEN]
Plant physiology (Bethesda), 2020-01, Vol.182 (3), p.1420-1439
2020
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Cis-Regulatory Code for Predicting Plant Cell-Type Transcriptional Response to High Salinity1[OPEN]
Plant physiology (Bethesda), 2019-09, Vol.181 (4), p.1739-1751
2019
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Transcriptome-Based Prediction of Complex Traits in Maize
The Plant cell, 2019-10, Vol.32 (1)
2019
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Predictive Models of Spatial Transcriptional Response to High Salinity1[OPEN]
Plant physiology (Bethesda), 2017-04, Vol.174 (1), p.450-464
2017
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Evolutionary characteristics of intergenic transcribed regions indicate rare novel genes and widespread noisy transcription in the Poaceae
Scientific reports, 2019-08, Vol.9 (1)
2019
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Cis-Regulatory Code for Predicting Plant Cell-Type Transcriptional Response to High Salinity1  [OPEN]
Plant physiology (Bethesda), 2019-11, Vol.181 (4), p.1739
2019
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Transcriptome-Based Prediction of Complex Traits in Maize[OPEN]
The Plant cell, 2020-01, Vol.32 (1), p.139
2020
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