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Genome-Wide Quantitative Enhancer Activity Maps Identified by STARR-seq
Science (American Association for the Advancement of Science), 2013-03, Vol.339 (6123), p.1074-1077
2013
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Enhancer–core-promoter specificity separates developmental and housekeeping gene regulation
Nature (London), 2015-02, Vol.518 (7540), p.556-559
2015
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Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters
Nature (London), 2019-06, Vol.570 (7759), p.122-126
2019
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Hormone-Responsive Enhancer-Activity Maps Reveal Predictive Motifs, Indirect Repression, and Targeting of Closed Chromatin
Molecular cell, 2014-04, Vol.54 (1), p.180-192
2014
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Quantitative genome-wide enhancer activity maps for five Drosophila species show functional enhancer conservation and turnover during cis-regulatory evolution
Nature genetics, 2014-07, Vol.46 (7), p.685-692
2014
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STARR-seq — Principles and applications
Genomics (San Diego, Calif.), 2015-09, Vol.106 (3), p.145-150
2015
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Differential cofactor dependencies define distinct types of human enhancers
Nature (London), 2022-06, Vol.606 (7913), p.406-413
2022
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A high‐throughput method to identify trans‐activation domains within transcription factor sequences
The EMBO journal, 2018-08, Vol.37 (16), p.n/a
2018
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Resolving systematic errors in widely used enhancer activity assays in human cells
Nature methods, 2018-02, Vol.15 (2), p.141-149
2018
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Genome-wide assessment of sequence-intrinsic enhancer responsiveness at single-base-pair resolution
Nature biotechnology, 2017-02, Vol.35 (2), p.136-144
2017
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STARR‐seq and UMI‐STARR‐seq: Assessing Enhancer Activities for Genome‐Wide‐, High‐, and Low‐Complexity Candidate Libraries
Current protocols in molecular biology (Print), 2019-09, Vol.128 (1), p.e105-n/a
2019
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Dissection of thousands of cell type-specific enhancers identifies dinucleotide repeat motifs as general enhancer features
Genome research, 2014-07, Vol.24 (7), p.1147-1156
2014
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STARR-seq Screening protocol
Protocol Exchange, 2017-12
2017
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qPCR assay to measure ISG expression in human cells
Protocol Exchange, 2017-12
2017
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qPCR based reporter assay on luciferase transcripts
Protocol Exchange, 2017-12
2017
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STARR-seq Library Preparation
Protocol Exchange, 2017-11
2017
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