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QQS orphan gene regulates carbon and nitrogen partitioning across species via NF-YC interactions
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2015-11, Vol.112 (47), p.14734-14739
2015
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Swine-to-Ferret Transmission of Antigenically Drifted Contemporary Swine H3N2 Influenza A Virus Is an Indicator of Zoonotic Risk to Humans
Viruses, 2023-01, Vol.15 (2), p.331
2023
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Coming of age: orphan genes in plants
Trends in plant science, 2014-11, Vol.19 (11), p.698-708
2014
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Interspecies Transmission from Pigs to Ferrets of Antigenically Distinct Swine H1 Influenza A Viruses with Reduced Reactivity to Candidate Vaccine Virus Antisera as Measures of Relative Zoonotic Risk
Viruses, 2022-10, Vol.14 (11), p.2398
2022
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Machine Learning Prediction and Experimental Validation of Antigenic Drift in H3 Influenza A Viruses in Swine
mSphere, 2021-03, Vol.6 (2)
2021
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Swine Influenza A Viruses and the Tangled Relationship with Humans
Cold Spring Harbor perspectives in medicine, 2021-03, Vol.11 (3), p.a038737
2021
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Reverse-zoonoses of 2009 H1N1 pandemic influenza A viruses and evolution in United States swine results in viruses with zoonotic potential
PLoS pathogens, 2023-07, Vol.19 (7), p.e1011476-e1011476
2023
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Raising orphans from a metadata morass: A researcher's guide to re-use of public ’omics data
Plant science (Limerick), 2018-02, Vol.267, p.32-47
2018
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Mitochondrial divergence between slow- and fast-aging garter snakes
Experimental gerontology, 2015-11, Vol.71, p.135-146
2015
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classLog: Logistic regression for the classification of genetic sequences
Frontiers in virology (online), 2023-12, Vol.3
2023
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octoFLUshow: an Interactive Tool Describing Spatial and Temporal Trends in the Genetic Diversity of Influenza A Virus in U.S. Swine
Microbiology resource announcements, 2021-12, Vol.10 (50), p.e0108121-e0108121
2021
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Characterizing a century of genetic diversity and contemporary antigenic diversity of N1 neuraminidase in influenza A virus from North American swine
Virus evolution, 2023, Vol.9 (1), p.vead015
2023
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Reverse-zoonoses of 2009 H1N1 pandemic influenza A viruses and evolution in United States swine results in viruses with zoonotic potential
PLoS pathogens, 2023-07, Vol.19 (7)
2023
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smot: a python package and CLI tool for contextual phylogenetic subsampling
Journal of open source software, 2022-12, Vol.7 (80), p.4193
2022
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QQSorphan gene regulates carbon and nitrogen partitioning across species via NF-YC interactions
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2015-11, Vol.112 (47), p.14734-14739
2015
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