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xCell: digitally portraying the tissue cellular heterogeneity landscape
Genome Biology, 2017-11, Vol.18 (1), p.220-220, Article 220
2017
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Reference-based analysis of lung single-cell sequencing reveals a transitional profibrotic macrophage
Nature immunology, 2019-02, Vol.20 (2), p.163
2019
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DNA Methylation of Transcriptional Enhancers and Cancer Predisposition
Cell, 2013-07, Vol.154 (1), p.11-13
2013
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DNA methylation of distal regulatory sites characterizes dysregulation of cancer genes
Genome biology, 2013-03, Vol.14 (3), p.R21-R21
2013
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Comprehensive analysis of normal adjacent to tumor transcriptomes
Nature communications, 2017-10, Vol.8 (1), p.1077-14, Article 1077
2017
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Replication timing-related and gene body-specific methylation of active human genes
Human molecular genetics, 2011-02, Vol.20 (4), p.670-680
2011
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Cell-Type Enrichment Analysis of Bulk Transcriptomes Using xCell
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2020, Vol.2120, p.263
2020
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Digitally deconvolving the tumor microenvironment
Genome Biology, 2016-08, Vol.17 (1), p.175-175, Article 175
2016
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Widespread parainflammation in human cancer
Genome Biology, 2016-07, Vol.17 (1), p.145, Article 145
2016
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CNS fibroblasts form a fibrotic scar in response to immune cell infiltration
Nature neuroscience, 2021-02, Vol.24 (2), p.234
2021
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Molecular programs of fibrotic change in aging human lung
Nature communications, 2021-11, Vol.12 (1), p.6309-6309, Article 6309
2021
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Genome-wide survey reveals predisposing diabetes type 2-related DNA methylation variations in human peripheral blood
Human molecular genetics, 2012-01, Vol.21 (2), p.371-383
2012
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Human splice factors contribute to latent HIV infection in primary cell models and blood CD4+ T cells from ART-treated individuals
PLoS pathogens, 2020-11, Vol.16 (11), p.e1009060-e1009060
2020
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Comparative Analysis of First-Line FOLFOX Treatment With and Without Anti-VEGF Therapy in Metastatic Colorectal Carcinoma: A Real-World Data Study
Cancer control, 2023-09, Vol.30, p.10732748231202470-10732748231202470
2023
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Cancer Cell-Autonomous Parainflammation Mimics Immune Cell Infiltration
Cancer research (Chicago, Ill.), 2017-07, Vol.77 (14), p.3740-3744
2017
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Heterogeneity in HIV and cellular transcription profiles in cell line models of latent and productive infection: implications for HIV latency
Retrovirology, 2019-11, Vol.16 (1), p.32-32, Article 32
2019
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Integration of transcription regulation and functional genomic data reveals lncRNA SNHG6's role in hematopoietic differentiation and leukemia
Journal of biomedical science, 2024-02, Vol.31 (1), p.27-27, Article 27
2024
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Correction: Corrigendum: Systematic pan-cancer analysis of tumour purity
Nature communications, 2016-02, Vol.7 (1), p.1-1, Article 10707
2016
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Transformer-based time-to-event prediction for chronic kidney disease deterioration
Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA, 2024-04, Vol.31 (4), p.980-990
2024
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Comparison of FOLFIRINOX vs Gemcitabine Plus Nab-Paclitaxel as First-Line Chemotherapy for Metastatic Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
JAMA network open, 2022-06, Vol.5 (6), p.e2216199
2022
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Systematic pan-cancer analysis of tumour purity
Nature communications, 2015-12, Vol.6 (1), p.8971-8971, Article 8971
2015
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Embryonic Stem Cell (ES)-Specific Enhancers Specify the Expression Potential of ES Genes in Cancer
PLoS genetics, 2016-02, Vol.12 (2), p.e1005840-e1005840
2016
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Global Transcriptome Analysis of RNA Abundance Regulation by ADAR in Lung Adenocarcinoma
EBioMedicine, 2018-01, Vol.27 (C), p.167-175
2018
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MAM: Flexible Monte-Carlo Agent based model for modelling COVID-19 spread
Journal of biomedical informatics, 2023-05, Vol.141, p.104364-104364, Article 104364
2023
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Cross-tissue Analysis of Gene and Protein Expression in Normal and Cancer Tissues
Scientific reports, 2016-05, Vol.6 (1), p.24799-24799, Article 24799
2016
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