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Mechanism of Unidirectional Move of KIF1A Motor Studied by Coarse-Grained Simulations

Biophysical journal, 2010-01, Vol.98 (3), p.167a-167a

2010

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1P136 Coarse-grained simulation of protein-DNA complex : mechanical unzipping of nucleosome(Nucleic acid:Interaction & Complex formation,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2010/08/15, Vol.50(supplement2), pp.S43

2010

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1P136 タンパク質-DNA複合体の粗視化シミュレーション : ヌクレオソームの力学的なアンジッピング(核酸-相互作用・複合体,第48回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2010/08/15, Vol.50(supplement2), pp.S43

2010

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1TP5-07 Coarse-grained simulation of protein-DNA complex : dynamics of nucleosome(The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S38

2009

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1P-099 タンパク質-DNA複合体の粗視化シミュレーション : ヌクレオソームのダイナミクス(核酸-相互作用・複合体,第47回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S79

2009

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1TP5-07 タンパク質-DNA複合体の粗視化シミュレーション : ヌクレオソームのダイナミクス(核酸-相互作用・複合体,第47回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S38

2009

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1P-099 Coarse-grained simulation of protein-DNA complex : dynamics of nucleosome(Nucleic acid:Interaction & Complex formation, The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S79

2009

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2P-110 Coarse-grained molecular simulation of protein-DNA complex(The 46th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2008/10/25, Vol.48(supplement), pp.S92

2008

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2P-110 タンパク質-DNA複合体の疎視化モデルによるシミュレーション(核酸結合蛋白質,第46回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2008/10/25, Vol.48(supplement), pp.S92

2008

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Coarse-grained protein model, cooperativity of folding and subdomain structure

Chemical physics letters, 2006-05, Vol.422 (4), p.429-433

2006

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Biomolecular Coarse-Grained Simulation Program CafeMol

Biophysical journal, 2010-01, Vol.98 (3), p.574a-574a

2010

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Structure-based Molecular Simulations Reveal the Enhancement of Biased Brownian Motions in Single-headed Kinesin. e1002907

PLoS computational biology, 2013-02, Vol.9 (2)

2013

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2P144 Conformational change of motor proteins described by extended Go-like model(Molecular motors,Poster Presentations)

Seibutsu Butsuri, 2007/11/20, Vol.47(supplement), pp.S149

2007

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3PT007 粗視化分子シミュレーションを用いたT4 sliding clampのDNA上での勤きの解析(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

生物物理, 2012/08/15, Vol.52(supplement), pp.S156

2012

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3PT007 Movement of T4 sliding clamp on DNA studied by coarse-grained molecular simulations(The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2012/08/15, Vol.52(supplement), pp.S156

2012

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1P126 Nucleosome unwrapping dynamic studied by coarse-grained molecular simulations(Nucleic acid binding proteins,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2010/08/15, Vol.50(supplement2), pp.S41

2010

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1P126 粗視化シミュレーションによるヌクレオソームの動的構造解析(核酸結合蛋白質,第48回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2010/08/15, Vol.50(supplement2), pp.S41

2010

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2P120 Structural dynamics of tri-nucleosome studied by combination of coarse grained molecular simulation and SAXS(05A. Nucleic acid: Structure & Property,Poster,The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(BSJ2014))

Seibutsu Butsuri, 2014/08/20, Vol.54(supplement1-2), pp.S214

2014

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2P120 ヌクレオソーム3量体の構造ダイナミクスの粗視化分子動力学法とX線小角散乱による研究(05A. 核酸:構造・物性,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

生物物理, 2014/08/20, Vol.54(supplement1-2), pp.S214

2014

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1P-098 レプリカ交換法による巨大タンパク質-核酸複合系の粗視化シミュレーション研究(核酸-相互作用・複合体,第47回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S79

2009

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3P-183 Membrane morphology dynamics induced by proteins : Coarsegrained molecular simulations(Biol & Artifi memb.:Dynamics,The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S182

2009

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1P-098 Replica exchange simulations applied for coarse-grained models of giant protein-nucleic acid complex(Nucleic acid:Interaction & Complex formation, The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S79

2009

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3P-183 タンパク質によって誘起される膜形態ダイナミクス : 粗視化分子シミュレーション(生体膜・人工膜-ダイナミクス,第47回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S182

2009

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1TA4-02 Mechanism of unidirectional move of KIF1A motor studied by coarse-grained simulations(The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Seibutsu Butsuri, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S29

2009

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1TA4-02 KIF1A分子モーターの一方向性の運動発現機構のシミュレーション研究(分子モーター,第47回日本生物物理学会年会)

生物物理, 2009/09/20, Vol.49(supplement), pp.S29

2009

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1P-099 タンパク質-DNA複合体の粗視化シミュレーション : ヌクレオソームのダイナミクス(核酸-相互作用・複合体,第47回日本生物物理学会年会)

1TP5-07 タンパク質-DNA複合体の粗視化シミュレーション : ヌクレオソームのダイナミクス(核酸-相互作用・複合体,第47回日本生物物理学会年会)

1P-099 Coarse-grained simulation of protein-DNA complex : dynamics of nucleosome(Nucleic acid:Interaction & Complex formation, The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

2P-110 Coarse-grained molecular simulation of protein-DNA complex(The 46th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

2P-110 タンパク質-DNA複合体の疎視化モデルによるシミュレーション(核酸結合蛋白質,第46回日本生物物理学会年会)

Coarse-grained protein model, cooperativity of folding and subdomain structure

Biomolecular Coarse-Grained Simulation Program CafeMol

Structure-based Molecular Simulations Reveal the Enhancement of Biased Brownian Motions in Single-headed Kinesin. e1002907

2P144 Conformational change of motor proteins described by extended Go-like model(Molecular motors,Poster Presentations)

3PT007 粗視化分子シミュレーションを用いたT4 sliding clampのDNA上での勤きの解析(日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

3PT007 Movement of T4 sliding clamp on DNA studied by coarse-grained molecular simulations(The 50th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

1P126 Nucleosome unwrapping dynamic studied by coarse-grained molecular simulations(Nucleic acid binding proteins,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

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2P120 Structural dynamics of tri-nucleosome studied by combination of coarse grained molecular simulation and SAXS(05A. Nucleic acid: Structure & Property,Poster,The 52nd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(BSJ2014))

2P120 ヌクレオソーム3量体の構造ダイナミクスの粗視化分子動力学法とX線小角散乱による研究(05A. 核酸:構造・物性,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

1P-098 レプリカ交換法による巨大タンパク質-核酸複合系の粗視化シミュレーション研究(核酸-相互作用・複合体,第47回日本生物物理学会年会)

3P-183 Membrane morphology dynamics induced by proteins : Coarsegrained molecular simulations(Biol & Artifi memb.:Dynamics,The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

1P-098 Replica exchange simulations applied for coarse-grained models of giant protein-nucleic acid complex(Nucleic acid:Interaction & Complex formation, The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

3P-183 タンパク質によって誘起される膜形態ダイナミクス : 粗視化分子シミュレーション(生体膜・人工膜-ダイナミクス,第47回日本生物物理学会年会)

1TA4-02 Mechanism of unidirectional move of KIF1A motor studied by coarse-grained simulations(The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

1TA4-02 KIF1A分子モーターの一方向性の運動発現機構のシミュレーション研究(分子モーター,第47回日本生物物理学会年会)

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