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DeepPhospho accelerates DIA phosphoproteome profiling through in silico library generation
Nature communications, 2021-11, Vol.12 (1), p.6685-6685, Article 6685
2021
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Benchmarking commonly used software suites and analysis workflows for DIA proteomics and phosphoproteomics
Nature communications, 2023-01, Vol.14 (1), p.94-94, Article 94
2023
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Understanding the Mechanism of Thermotolerance Distinct From Heat Shock Response Through Proteomic Analysis of Industrial Strains of Saccharomyces cerevisiae
Molecular & cellular proteomics, 2015-07, Vol.14 (7), p.1885-1897
2015
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Acquisition and Analysis of DIA-Based Proteomic Data: A Comprehensive Survey in 2023
Molecular & cellular proteomics, 2024-02, Vol.23 (2), p.100712-100712, Article 100712
2024
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Proteomic Profiling and Functional Characterization of Multiple Post-Translational Modifications of Tubulin
Journal of proteome research, 2015-08, Vol.14 (8), p.3292-3304
2015
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Combining Untargeted and Targeted Proteomic Strategies for Discrimination and Quantification of Cashmere Fibers
PloS one, 2016-01, Vol.11 (1), p.e0147044-e0147044
2016
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Membrane proteomics of phagosomes suggests a connection to autophagy
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2008-11, Vol.105 (44), p.16952-16957
2008
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Quantitative Proteomic Profiling of Host−Pathogen Interactions: The Macrophage Response to Mycobacterium tuberculosis Lipids
Journal of proteome research, 2009-01, Vol.8 (1), p.282-289
2009
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Exploring skyline for both MS(E) -based label-free proteomics and HRMS quantitation of small molecules
Proteomics (Weinheim), 2014-02, Vol.14 (2-3), p.169-180
2014
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Organelle Membrane Proteomics Reveals Differential Influence of Mycobacterial Lipoglycans on Macrophage Phagosome Maturation and Autophagosome Accumulation
Journal of proteome research, 2011-01, Vol.10 (1), p.339-348
2011
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Glycoproteomic analysis of tissues from patients with colon cancer using lectin microarrays and nanoLC-MS/MS
Molecular bioSystems, 2013-01, Vol.9 (7), p.1877-1887
2013
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Reprogramming- and pluripotency-associated membrane proteins in mouse stem cells revealed by label-free quantitative proteomics
Journal of proteomics, 2013-06, Vol.86, p.70-84
2013
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Enhancing TOF/TOF-based de Novo Sequencing Capability for High Throughput Protein Identification with Amino Acid-Coded Mass Tagging
Journal of proteome research, 2005-01, Vol.4 (1), p.83-90
2005
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