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Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0
Nature communications, 2022-06, Vol.13 (1), p.3766-3766, Article 3766
2022
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Improving recombinant protein production by yeast through genome-scale modeling using proteome constraints
Nature communications, 2022-05, Vol.13 (1), p.2969-2969, Article 2969
2022
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Validated Growth Rate-Dependent Regulation of Lipid Metabolism in Yarrowia lipolytica
International journal of molecular sciences, 2022-08, Vol.23 (15), p.8517
2022
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Genome-scale metabolic modeling reveals metabolic trade-offs associated with lipid production in Rhodotorula toruloides
PLoS computational biology, 2023-04, Vol.19 (4), p.e1011009-e1011009
2023
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Probing the metabolic network in bloodstream-form Trypanosoma brucei using untargeted metabolomics with stable isotope labelled glucose
PLoS pathogens, 2015-03, Vol.11 (3), p.e1004689-e1004689
2015
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A Pan-Draft Metabolic Model Reflects Evolutionary Diversity across 332 Yeast Species
Biomolecules (Basel, Switzerland), 2022-11, Vol.12 (11), p.1632
2022
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Multiscale models quantifying yeast physiology: towards a whole-cell model
Trends in biotechnology (Regular ed.), 2022-03, Vol.40 (3), p.291-305
2022
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Adaptations in metabolism and protein translation give rise to the Crabtree effect in yeast
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2021-12, Vol.118 (51)
2021
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Reconstruction of a Genome-Scale Metabolic Model of Streptomyces albus J1074: Improved Engineering Strategies in Natural Product Synthesis
Metabolites, 2021-05, Vol.11 (5), p.304
2021
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Advancing metabolic engineering of Yarrowia lipolytica using the CRISPR/Cas system
Applied microbiology and biotechnology, 2018-11, Vol.102 (22), p.9541-9548
2018
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Genome-scale metabolic model of Pichia pastoris with native and humanized glycosylation of recombinant proteins
Biotechnology and bioengineering, 2016-05, Vol.113 (5), p.961-969
2016
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SLIMEr: probing flexibility of lipid metabolism in yeast with an improved constraint-based modeling framework
BMC systems biology, 2019-01, Vol.13 (1), p.4-4, Article 4
2019
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Probing the Metabolic Network in Bloodstream-Form Trypanosoma brucei Using Untargeted Metabolomics with Stable Isotope Labelled Glucose: e1004689
PLoS pathogens, 2015-03, Vol.11 (3)
2015
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