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Addressing the Digital Divide in Contemporary Biology: Lessons from Teaching UNIX
Trends in biotechnology (Regular ed.), 2017-10, Vol.35 (10), p.901-903
2017
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Challenges and recommendations to improve the installability and archival stability of omics computational tools
PLoS biology, 2019-06, Vol.17 (6), p.e3000333
2019
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Hidden Treasures in Contemporary RNA Sequencing
1st ed. 2019., 2019
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Analytical code sharing practices in biomedical research
PeerJ. Computer science, 2024-06, Vol.10, p.e2066, Article e2066
2024
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Accurate viral population assembly from ultra-deep sequencing data
Bioinformatics (Oxford, England), 2014-06, Vol.30 (12), p.i329-i337
2014
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Estimating Enzyme Expression and Metabolic Pathway Activity in Borreliella -Infected and Uninfected Mice
Journal of computational biology, 2024-06
2024
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Bioinformatics Research and Applications: 18th International Symposium, ISBRA 2022, Haifa, Israel, November 14–17, 2022, Proceedings
2023
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Involving undergraduates in genomics research to narrow the education-research gap
Nature biotechnology, 2018-04, Vol.36 (4), p.369-371
2018
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Long Single-Molecule Reads Can Resolve the Complexity of the Influenza Virus Composed of Rare, Closely Related Mutant Variants
Journal of computational biology, 2017-06, Vol.24 (6), p.558-570
2017
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Bioinformatics Research and Applications: 19th International Symposium, ISBRA 2023, Wrocław, Poland, October 9–12, 2023, Proceedings
2023
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Inferring Boolean Networks from Single-Cell Human Embryo Datasets
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.14248, p.431-441
2023
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Approximating Rearrangement Distances with Replicas and Flexible Intergenic Regions
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.14248, p.241-254
2023
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Fusing Label Relations for Chinese EMR Named Entity Recognition with Machine Reading Comprehension
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.41-51
2023
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NIDN: Medical Code Assignment via Note-Code Interaction Denoising Network
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.62-74
2023
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A Multimodal Data Fusion-Based Deep Learning Approach for Drug-Drug Interaction Prediction
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.275-285
2023
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EMRShareChain: A Privacy-Preserving EMR Sharing System Model Based on the Consortium Blockchain
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.343-355
2023
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GNN-Dom: An Unsupervised Method for Protein Domain Partition via Protein Contact Map
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.286-294
2023
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MPCDDI: A Secure Multiparty Computation-Based Deep Learning Framework for Drug-Drug Interaction Predictions
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.263-274
2023
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Deep Learning-Enhanced MHC-II Presentation Prediction and Peptidome Deconvolution
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.180-191
2023
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Heterogeneous PPI Network Representation Learning for Protein Complex Identification
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.217-228
2023
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Distance Profiles of Optimal RNA Foldings
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.315-329
2023
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An SMT-Based Framework for Reasoning About Discrete Biological Models
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.114-125
2023
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Entropy Based Clustering of Viral Sequences
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.369-380
2023
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Transposition Distance Considering Intergenic Regions for Unbalanced Genomes
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.100-113
2023
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ARGLRR: An Adjusted Random Walk Graph Regularization Sparse Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA-Sequencing Data Clustering
Bioinformatics Research and Applications, 2023, Vol.13760, p.126-137
2023
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