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The Unfinished Reconstructed Nature of the Last Universal Common Ancestor
Journal of molecular evolution, 2024-07
2024
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An Upgrade on the Surveillance System of SARS-CoV-2: Deployment of New Methods for Genetic Inspection
International journal of molecular sciences, 2022-03, Vol.23 (6), p.3143
2022
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CurSa: scripts to curate metadata and sample genomes from GISAID for analysis and display in nextstrain and microreact
Biology methods and protocols, 2023, Vol.8 (1), p.bpad007-bpad007
2023
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SARELI: Sequence Alignment by Radial Evaluation of Local Interactions
Current bioinformatics, 2018-01, Vol.13 (3), p.290-298
2018
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Untangling the Evolution of the Receptor-Binding Motif of SARS-CoV-2
Journal of molecular evolution, 2024-06, Vol.92 (3), p.329-337
2024
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Translation Comes First: Ancient and Convergent Selection of Codon Usage Bias Across Prokaryotic Genomes
Journal of molecular evolution, 2022-12, Vol.90 (6), p.438-451
2022
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Inferring Horizontal Gene Transfer with DarkHorse, Phylomizer, and ETE Toolkits
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2020, Vol.2075, p.355
2020
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Protein Disulfide Oxidoreductases and the Evolution of Thermophily: Was the Last Common Ancestor a Heat-Loving Microbe
Journal of molecular evolution, 2007-09, Vol.65 (3), p.296-303
2007
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Evolution of reduced prokaryotic genomes and the minimal cell concept: Variations on a theme
BioEssays, 2010-04, Vol.32 (4), p.281-287
2010
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Molecular evolution of peptide methionine sulfoxide reductases (MsrA and MsrB): on the early development of a mechanism that protects against oxidative damage
Journal of molecular evolution, 2007-01, Vol.64 (1), p.15-32
2007
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Loss of DNA: A plausible molecular level explanation for crustacean neuropeptide gene evolution
Peptides (New York, N.Y. : 1980), 2007, Vol.28 (1), p.76-82
2007
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