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Comparative genomics as a time machine: how relative gene dosage and metabolic requirements shaped the time-dependent resolution of yeast polyploidy
Molecular biology and evolution, 2014-12, Vol.31 (12), p.3184-3193
2014
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GenomeVx: simple web-based creation of editable circular chromosome maps
Bioinformatics, 2008-03, Vol.24 (6), p.861-862
2008
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butterfly plant arms-race escalated by gene and genome duplications
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2015-07, Vol.112 (27), p.8362-8366
2015
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Independent sorting-out of thousands of duplicated gene pairs in two yeast species descended from a whole-genome duplication
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2007-05, Vol.104 (20), p.8397-8402
2007
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Functional partitioning of yeast co-expression networks after genome duplication
PLoS biology, 2006-04, Vol.4 (4), p.e109-e109
2006
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Watching the grin fade: Tracing the effects of polyploidy on different evolutionary time scales
Seminars in cell & developmental biology, 2013-04, Vol.24 (4), p.320-331
2013
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Probabilistic Cross-Species Inference of Orthologous Genomic Regions Created by Whole-Genome Duplication in Yeast
Genetics (Austin), 2008-07, Vol.179 (3), p.1681-1692
2008
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Molecular evolution in large genetic networks: does connectivity equal constraint?
Journal of molecular evolution, 2004-02, Vol.58 (2), p.203-211
2004
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Polyploidy and the Evolution of Complex Traits
International Journal of Evolutionary Biology, 2012, Vol.2012, p.292068-12
2012
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Nonrandom survival of gene conversions among yeast ribosomal proteins duplicated through genome doubling
Genome biology and evolution, 2010-01, Vol.2, p.826-834
2010
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Effects of nucleotide composition bias on the success of the parsimony criterion in phylogenetic inference
Molecular biology and evolution, 2001-06, Vol.18 (6), p.1024-1033
2001
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Altered patterns of fractionation and exon deletions in Brassica rapa support a two-step model of paleohexaploidy
Genetics (Austin), 2012-04, Vol.190 (4), p.1563-1574
2012
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