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ParallelStructure: a R package to distribute parallel runs of the population genetics program STRUCTURE on multi-core computers
PloS one, 2013-07, Vol.8 (7), p.e70651-e70651
2013
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Determining the most important physiological and agronomic traits contributing to maize grain yield through machine learning algorithms: a new avenue in intelligent agriculture
PloS one, 2014-05, Vol.9 (5), p.e97288-e97288
2014
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Tissue-Specific Evolution of Protein Coding Genes in Human and Mouse
PloS one, 2015-06, Vol.10 (6), p.e0131673-e0131673
2015
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Comorbid Analysis of Genes Associated with Autism Spectrum Disorders Reveals Differential Evolutionary Constraints
PloS one, 2016-07, Vol.11 (7), p.e0157937-e0157937
2016
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How Many Genes Are Expressed in a Transcriptome? Estimation and Results for RNA-Seq
PloS one, 2015-06, Vol.10 (6), p.e0130262-e0130262
2015
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Predicting plastid marker variation: can complete plastid genomes from closely related species help?
PloS one, 2013-11, Vol.8 (11), p.e82266-e82266
2013
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How to Make a Dolphin: Molecular Signature of Positive Selection in Cetacean Genome
PloS one, 2013-06, Vol.8 (6), p.e65491-e65491
2013
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Prevalent Accumulation of Non-Optimal Codons through Somatic Mutations in Human Cancers
PloS one, 2016-08, Vol.11 (8), p.e0160463-e0160463
2016
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A new orchid genus, Danxiaorchis, and phylogenetic analysis of the tribe Calypsoeae
PloS one, 2013-04, Vol.8 (4), p.e60371-e60371
2013
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A phylogeny-based benchmarking test for orthology inference reveals the limitations of function-based validation
PloS one, 2014-11, Vol.9 (11), p.e111122-e111122
2014
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Adaptive Molecular Evolution of PHYE in Primulina, a Karst Cave Plant
PloS one, 2015-06, Vol.10 (6), p.e0127821-e0127821
2015
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Unraveling the protein network of tomato fruit in response to necrotrophic phytopathogenic Rhizopus nigricans
PloS one, 2013-09, Vol.8 (9), p.e73034-e73034
2013
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On the validity of evolutionary models with site-specific parameters
PloS one, 2014-04, Vol.9 (4), p.e94534-e94534
2014
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From P-Values to Objective Probabilities in Assessing Medical Treatments
PloS one, 2015-11, Vol.10 (11), p.e0142132-e0142132
2015
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Bayesian parameter inference and model selection by population annealing in systems biology
PloS one, 2014-08, Vol.9 (8), p.e104057-e104057
2014
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Constraints on genome dynamics revealed from gene distribution among the Ralstonia solanacearum species
PloS one, 2013-05, Vol.8 (5), p.e63155-e63155
2013
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Positive selection of deleterious alleles through interaction with a sex-ratio suppressor gene in African Buffalo: a plausible new mechanism for a high frequency anomaly
PloS one, 2014-11, Vol.9 (11), p.e111778
2014
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Inferring gene family histories in yeast identifies lineage specific expansions
PloS one, 2014-06, Vol.9 (6), p.e99480
2014
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An effective filter for IBD detection in large data sets
PloS one, 2014-03, Vol.9 (3), p.e92713-e92713
2014
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Do spatially-implicit estimates of neutral migration comply with seed dispersal data in tropical forests?
PloS one, 2013-08, Vol.8 (8), p.e72497-e72497
2013
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A solution to the challenge of optimization on ''golf-course''-like fitness landscapes
PloS one, 2013-11, Vol.8 (11), p.e78401-e78401
2013
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Correction: Unraveling the Protein Network of Tomato Fruit in Response to Necrotrophic Phytopathogenic Rhizopus nigricans
PloS one, 2013-10, Vol.8 (10)
2013
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Cryo-electron microscopy of adipose tissue extracellular vesicles in obesity and type 2 diabetes mellitus
PloS one, 2023-02, Vol.18 (2), p.e0279652-e0279652
2023
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Unraveling patterns of site-to-site synonymous rates variation and associated gene properties of protein domains and families
PloS one, 2014-06, Vol.9 (6), p.e95034-e95034
2014
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Clinical and molecular markers in retinal detachment-From hyperreflective points to stem cells and inflammation
PloS one, 2019-06, Vol.14 (6), p.e0217548-e0217548
2019
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