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Enhanced Global Post-translational Modification Discovery with MetaMorpheus
Journal of proteome research, 2018-05, Vol.17 (5), p.1844-1851
2018
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Global Identification of Post-Translationally Spliced Peptides with Neo-Fusion
Journal of proteome research, 2019-01, Vol.18 (1), p.349-358, Article acs.jproteome.8b00651
2019
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Global Post-Translational Modification Discovery
Journal of proteome research, 2017-04, Vol.16 (4), p.1383-1390
2017
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Spritz: A Proteogenomic Database Engine
Journal of proteome research, 2021-04, Vol.20 (4), p.1826-1834
2021
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Large-Scale Mass Spectrometric Detection of Variant Peptides Resulting from Nonsynonymous Nucleotide Differences
Journal of proteome research, 2014-01, Vol.13 (1), p.228-240
2014
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Elucidating Escherichia coli Proteoform Families Using Intact-Mass Proteomics and a Global PTM Discovery Database
Journal of proteome research, 2017-11, Vol.16 (11), p.4156-4165
2017
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Elucidating Proteoform Families from Proteoform Intact-Mass and Lysine-Count Measurements
Journal of proteome research, 2016-04, Vol.15 (4), p.1213-1221
2016
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Proteoform Suite: Software for Constructing, Quantifying, and Visualizing Proteoform Families
Journal of proteome research, 2018-01, Vol.17 (1), p.568-578
2018
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Constructing Human Proteoform Families Using Intact-Mass and Top-Down Proteomics with a Multi-Protease Global Post-Translational Modification Discovery Database
Journal of proteome research, 2019-10, Vol.18 (10), p.3671-3680
2019
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MetaNetwork Enhances Biological Insights from Quantitative Proteomics Differences by Combining Clustering and Enrichment Analyses
Journal of proteome research, 2022-02, Vol.21 (2), p.410-419
2022
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Discovery of Dehydroamino Acid Residues in the Capsid and Matrix Structural Proteins of HIV‑1
Journal of proteome research, 2022-04, Vol.21 (4), p.993-1001
2022
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Global Identification of Protein Post-translational Modifications in a Single-Pass Database Search
Journal of proteome research, 2015-11, Vol.14 (11), p.4714-4720
2015
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Identification and Quantification of Murine Mitochondrial Proteoforms Using an Integrated Top-Down and Intact-Mass Strategy
Journal of proteome research, 2018-10, Vol.17 (10), p.3526-3536
2018
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Binary Classifier for Computing Posterior Error Probabilities in MetaMorpheus
Journal of proteome research, 2021-04, Vol.20 (4), p.1997-2004
2021
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Human Proteomic Variation Revealed by Combining RNA-Seq Proteogenomics and Global Post-Translational Modification (G-PTM) Search Strategy
Journal of proteome research, 2016-03, Vol.15 (3), p.800-808
2016
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Discovery of Chromatin-Associated Proteins via Sequence-Specific Capture and Mass Spectrometric Protein Identification in Saccharomyces cerevisiae
Journal of proteome research, 2014-08, Vol.13 (8), p.3810-3825
2014
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Correction to “Elucidating Proteoform Families from Proteoform Intact-Mass and Lysine-Count Measurements”
Journal of proteome research, 2017-07, Vol.16 (7), p.2660-2660
2017
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Large-scale mass spectrometric detection of variant peptides resulting from non-synonymous nucleotide differences
Journal of proteome research, 2013-11, Vol.13 (1), p.228-240
2013
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