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Small interfering RNAs from bidirectional transcripts of GhMML3_A12 regulate cotton fiber development
The New phytologist, 2016-06, Vol.210 (4), p.1298-1310
2016
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The cbfs triple mutants reveal the essential functions of CBFs in cold acclimation and allow the definition of CBF regulons in Arabidopsis
The New phytologist, 2016-10, Vol.212 (2), p.345-353
2016
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Designing a transcriptome next-generation sequencing project for a nonmodel plant species
American journal of botany, 2012-02, Vol.99 (2), p.257-266
2012
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Recent origination of circular RNAs in plants
The New phytologist, 2022-01, Vol.233 (1), p.515-525
2022
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Single‐cell RNA‐sequencing of Nicotiana attenuata corolla cells reveals the biosynthetic pathway of a floral scent
The New phytologist, 2022-04, Vol.234 (2), p.527-544
2022
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comparison of statistical methods for detecting differentially expressed genes from RNA-seq data
American journal of botany, 2012-02, Vol.99 (2), p.248-256
2012
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Widespread anti‐sense transcription in apple is correlated with siRNA production and indicates a large potential for transcriptional and/or post‐transcriptional control
The New phytologist, 2014-07, Vol.203 (1), p.287-299
2014
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Applications of next-generation sequencing in plant biology
American journal of botany, 2012-02, Vol.99 (2), p.175-185
2012
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Osmotic stress enhances suberization of apoplastic barriers in barley seminal roots: analysis of chemical, transcriptomic and physiological responses
The New phytologist, 2019-01, Vol.221 (1), p.180-194
2019
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Resolution of deep eudicot phylogeny and their temporal diversification using nuclear genes from transcriptomic and genomic datasets
The New phytologist, 2017-05, Vol.214 (3), p.1338-1354
2017
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Comparative metabolomic analysis reveals a reactive oxygen species-dominated dynamic model underlying chilling environment adaptation and tolerance in rice
The New phytologist, 2016-09, Vol.211 (4), p.1295-1310
2016
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Identification of microRNAs and their mRNA targets during soybean nodule development: functional analysis of the role of miR393j-3p in soybean nodulation
The New phytologist, 2015-08, Vol.207 (3), p.748-759
2015
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liverwort Pellia endiviifolia shares microtranscriptomic traits that are common to green algae and land plants
The New phytologist, 2015-04, Vol.206 (1), p.352-367
2015
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Sex-biased gene expression in dioecious garden asparagus (Asparagus officinalis)
The New phytologist, 2015-08, Vol.207 (3), p.883-892
2015
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Eucalyptus grandis R2R3‐MYB transcription factor family: evidence for woody growth‐related evolution and function
The New phytologist, 2015-06, Vol.206 (4), p.1364-1377
2015
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Identification of new marker genes from plant single‐cell RNA‐seq data using interpretable machine learning methods
The New phytologist, 2022-05, Vol.234 (4), p.1507-1520
2022
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Statistical Framework for eQTL Mapping Using RNA‐seq Data
Biometrics, 2012-03, Vol.68 (1), p.1-11
2012
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MicroRNAs, the epigenetic memory and climatic adaptation in Norway spruce
The New phytologist, 2010-09, Vol.187 (4), p.1154-1169
2010
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Shifts in gene expression profiles are associated with weak and strong Crassulacean acid metabolism
American journal of botany, 2018-03, Vol.105 (3), p.587-601
2018
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Transcriptional reprogramming by root knot and migratory nematode infection in rice
The New phytologist, 2012-11, Vol.196 (3), p.887-900
2012
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AtRTD – a comprehensive reference transcript dataset resource for accurate quantification of transcript-specific expression in Arabidopsis thaliana
The New phytologist, 2015-10, Vol.208 (1), p.96-101
2015
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High-quality reference transcript datasets hold the key to transcript-specific RNA-sequencing analysis in plants
The New phytologist, 2017-01, Vol.213 (2), p.525-530
2017
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Genome‐wide analysis of the lignin toolbox of Eucalyptus grandis
The New phytologist, 2015-06, Vol.206 (4), p.1297-1313
2015
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A comparative transcriptomic study of an allotetraploid and its diploid progenitors illustrates the unique advantages and challenges of RNA-seq in plant species
American journal of botany, 2012-02, Vol.99 (2), p.383-396
2012
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Estimating cell type composition using isoform expression one gene at a time
Biometrics, 2023-06, Vol.79 (2), p.854-865
2023
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