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Genomic patterns and context specific interpretation of DNA methylation
Current opinion in genetics & development, 2014-04, Vol.25, p.85-92
2014
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Methylation-Dependent and -Independent Genomic Targeting Principles of the MBD Protein Family
Cell, 2013-04, Vol.153 (2), p.480-492
2013
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Identification of genetic elements that autonomously determine DNA methylation states
Nature genetics, 2011-11, Vol.43 (11), p.1091-1097
2011
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Evidence that direct inhibition of transcription factor binding is the prevailing mode of gene and repeat repression by DNA methylation
Nature genetics, 2022-12, Vol.54 (12), p.1895-7
2022
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Genetics and epigenetics: stability and plasticity during cellular differentiation
Trends in genetics, 2009-03, Vol.25 (3), p.129-136
2009
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Molecular Co-occupancy Identifies Transcription Factor Binding Cooperativity In Vivo
Molecular cell, 2021-01, Vol.81 (2), p.255-267.e6
2021
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Transcription factor occupancy can mediate active turnover of DNA methylation at regulatory regions
PLoS genetics, 2013-12, Vol.9 (12), p.e1003994
2013
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Genomation: a toolkit to summarize, annotate and visualize genomic intervals
Bioinformatics, 2015-04, Vol.31 (7), p.1127-1129
2015
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Genomic patterns of DNA methylation: targets and function of an epigenetic mark
Current opinion in cell biology, 2007-06, Vol.19 (3), p.273-280
2007
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YAP1 Exerts Its Transcriptional Control via TEAD-Mediated Activation of Enhancers
PLoS genetics, 2015-08, Vol.11 (8), p.e1005465-e1005465
2015
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Determinants and dynamics of genome accessibility
Nature reviews. Genetics, 2011-08, Vol.12 (8), p.554
2011
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Sox4 Is a Master Regulator of Epithelial-Mesenchymal Transition by Controlling Ezh2 Expression and Epigenetic Reprogramming
Cancer cell, 2013-06, Vol.23 (6), p.768-783
2013
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Aging-Dependent Demethylation of Regulatory Elements Correlates with Chromatin State and Improved β Cell Function
Cell metabolism, 2015-10, Vol.22 (4), p.619-632
2015
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monaLisa: an R/Bioconductor package for identifying regulatory motifs
Bioinformatics (Oxford, England), 2022-04, Vol.38 (9), p.2624-2625
2022
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Distribution, silencing potential and evolutionary impact of promoter DNA methylation in the human genome
Nature genetics, 2007-04, Vol.39 (4), p.457-466
2007
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Targets and dynamics of promoter DNA methylation during early mouse development
Nature genetics, 2010-12, Vol.42 (12), p.1093-1100
2010
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Epigenomics Methylation matters
Nature (London), 2009-11, Vol.462 (7271), p.296-297
2009
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Pioneering Activity of the C-Terminal Domain of EBF1 Shapes the Chromatin Landscape for B Cell Programming
Immunity (Cambridge, Mass.), 2016-03, Vol.44 (3), p.527-541
2016
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Repressive and active histone methylation mark distinct promoters in human and mouse spermatozoa
Nature structural & molecular biology, 2010-06, Vol.17 (6), p.679
2010
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Lineage-Specific Polycomb Targets and De Novo DNA Methylation Define Restriction and Potential of Neuronal Progenitors
Molecular cell, 2008-06, Vol.30 (6), p.755-766
2008
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Characterizing Light-Regulated Retinal MicroRNAs Reveals Rapid Turnover as a Common Property of Neuronal MicroRNAs
Cell, 2010-05, Vol.141 (4), p.618-631
2010
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Global reorganization of replication domains during embryonic stem cell differentiation
PLoS biology, 2008-10, Vol.6 (10), p.e245-e245
2008
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Chromatin in Multicolor
Cell, 2010-10, Vol.143 (2), p.183-184
2010
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A chromatin-modifying function of JNK during stem cell differentiation
Nature genetics, 2012-01, Vol.44 (1), p.94-100
2012
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Chromosome-wide and promoter-specific analyses identify sites of differential DNA methylation in normal and transformed human cells
Nature genetics, 2005-08, Vol.37 (8), p.853-862
2005
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