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Essential dynamics: foundation and applications
Wiley interdisciplinary reviews. Computational molecular science, 2012-09, Vol.2 (5), p.762-770
2012
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Dynamical fingerprints for probing individual relaxation processes in biomolecular dynamics with simulations and kinetic experiments
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2011-03, Vol.108 (12), p.4822-4827
2011
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Molecular Dynamics Simulation of Sperm Whale Myoglobin: Effects of Mutations and Trapped CO on the Structure and Dynamics of Cavities
Biophysical journal, 2005-07, Vol.89 (1), p.465-474
2005
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Fully Atomistic Multiscale Approach for p K a Prediction
The journal of physical chemistry. B, 2020-06, Vol.124 (23), p.4712-4722
2020
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Molecular Dynamics Simulation of Protein Folding by Essential Dynamics Sampling: Folding Landscape of Horse Heart Cytochrome c
Biophysical journal, 2003-11, Vol.85 (5), p.2865-2871
2003
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Thermodynamic Evolution of a Metamorphic Protein: A Theoretical-Computational Study of Human Lymphotactin
The Protein Journal, 2023-06, Vol.42 (3), p.219-228
2023
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A quantitative connection of experimental and simulated folding landscapes by vibrational spectroscopy
Chemical science (Cambridge), 2018-12, Vol.9 (48), p.9002-9011
2018
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Unambiguous Assignment of Reduction Potentials in Diheme Cytochromes
The journal of physical chemistry. B, 2014-07, Vol.118 (27), p.7554-7560
2014
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Molecular Origin of Gerstmann-Sträussler-Scheinker Syndrome: Insight from Computer Simulation of an Amyloidogenic Prion Peptide
Biophysical journal, 2011-06, Vol.100 (12), p.3000-3007
2011
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Instantaneous Normal Modes and the Protein Glass Transition
Biophysical journal, 2009-01, Vol.96 (2), p.476-484
2009
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Instantaneous Normal Modes and the Protein Glass Transition
Biophysical journal, 2009-01, Vol.96 (2)
2009
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Solvent Electrostriction-Driven Peptide Folding Revealed by Quasi-Gaussian Entropy Theory and Molecular Dynamics Simulation
The journal of physical chemistry. B, 2008-09, Vol.112 (35), p.11155-11163
2008
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Selective Excitation of Native Fluctuations during Thermal Unfolding Simulations: Horse Heart Cytochrome c as a Case Study
Biophysical journal, 2003-03, Vol.84 (3), p.1876-1883
2003
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Dehydration-Driven Solvent Exposure of Hydrophobic Surfaces as a Driving Force in Peptide Folding
Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2007-09, Vol.104 (39)
2007
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