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Complete, closed bacterial genomes from microbiomes using nanopore sequencing
Nature biotechnology, 2020-06, Vol.38 (6), p.701-707
2020
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Precision identification of diverse bloodstream pathogens in the gut microbiome
Nature medicine, 2018-12, Vol.24 (12), p.1809-1814
2018
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Microbes and microbiomes in 2020 and beyond
Nature communications, 2020-10, Vol.11 (1), p.4988-4988, Article 4988
2020
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Acquisition, transmission and strain diversity of human gut-colonizing crAss-like phages
Nature communications, 2020-01, Vol.11 (1), p.280-280, Article 280
2020
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MetaRibo-Seq measures translation in microbiomes
Nature communications, 2020-06, Vol.11 (1), p.3268-3268, Article 3268
2020
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Surveying Gut Microbiome Research in Africans: Toward Improved Diversity and Representation
Trends in microbiology (Regular ed.), 2019-10, Vol.27 (10), p.824-835
2019
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Metagenomic compendium of 189,680 DNA viruses from the human gut microbiome
Nature microbiology, 2021-07, Vol.6 (7), p.960
2021
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Comparative genomics identifies thousands of candidate structured RNAs in human microbiomes
Genome Biology, 2021-04, Vol.22 (1), p.100-100, Article 100
2021
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Antimicrobial exposure is associated with decreased survival in triple-negative breast cancer
Nature communications, 2023-04, Vol.14 (1), p.2053-2053, Article 2053
2023
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Intestinal microbiota domination under extreme selective pressures characterized by metagenomic read cloud sequencing and assembly
BMC bioinformatics, 2019-12, Vol.20 (Suppl 16), p.585-585, Article 585
2019
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Phage-inclusive profiling of human gut microbiomes with Phanta
Nature biotechnology, 2024-04, Vol.42 (4), p.651-662
2024
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Making the microbiome personal
Nature medicine, 2019-05, Vol.25 (5), p.708-708
2019
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Improved high-molecular-weight DNA extraction, nanopore sequencing and metagenomic assembly from the human gut microbiome
Nature protocols, 2021-01, Vol.16 (1), p.458-471
2021
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Quantifying bias introduced by sample collection in relative and absolute microbiome measurements
Nature biotechnology, 2024-02, Vol.42 (2), p.328-338
2024
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A compilation of fecal microbiome shotgun metagenomics from hematopoietic cell transplantation patients
Scientific data, 2022-05, Vol.9 (1), p.219-219, Article 219
2022
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Simultaneous ribosome profiling of hundreds of microbes from the human microbiome
Nature protocols, 2021-10, Vol.16 (10), p.4676-4691
2021
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High-quality genome sequences of uncultured microbes by assembly of read clouds
Nature biotechnology, 2018-12, Vol.36 (11), p.1067-1075
2018
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Author Correction: Quantifying bias introduced by sample collection in relative and absolute microbiome measurements
Nature biotechnology, 2024-08, Vol.42 (8), p.1313-1313
2024
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The gut microbiome: a missing link in understanding the gastrointestinal manifestations of COVID-19?
Cold Spring Harbor molecular case studies, 2021-04, Vol.7 (2), p.a006031
2021
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Microbiome genome structure drives function
Nature microbiology, 2019-06, Vol.4 (6), p.912
2019
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Sampling techniques and microbial concentration measurements influence the results of microbiome studies
Nature biotechnology, 2024-02, Vol.42 (2), p.194-195
2024
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Short- and long-read metagenomics of urban and rural South African gut microbiomes reveal a transitional composition and undescribed taxa
Nature communications, 2022-02, Vol.13 (1), p.926-926, Article 926
2022
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