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Changes in intestinal barrier function and gut microbiota in high-fat diet-fed rats are dynamic and region dependent
American journal of physiology: Gastrointestinal and liver physiology, 2015-05, Vol.308 (10), p.G840-G851
2015
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SAMSA2: a standalone metatranscriptome analysis pipeline
BMC bioinformatics, 2018-05, Vol.19 (1), p.175-175, Article 175
2018
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RNA sequencing of the human milk fat layer transcriptome reveals distinct gene expression profiles at three stages of lactation
PloS one, 2013-07, Vol.8 (7), p.e67531-e67531
2013
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Pilot study of probiotic/colostrum supplementation on gut function in children with autism and gastrointestinal symptoms
PloS one, 2019-01, Vol.14 (1), p.e0210064-e0210064
2019
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Human milk oligosaccharides in premature infants: absorption, excretion, and influence on the intestinal microbiota
Pediatric research, 2015-12, Vol.78 (6), p.670-677
2015
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Reservoirs of antimicrobial resistance genes in retail raw milk
Microbiome, 2020-06, Vol.8 (1), p.99-15, Article 99
2020
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Maternal fucosyltransferase 2 status affects the gut bifidobacterial communities of breastfed infants
Microbiome, 2015-04, Vol.3 (1), p.13-13, Article 13
2015
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Pre- and post-sequencing recommendations for functional annotation of human fecal metagenomes
BMC bioinformatics, 2020-02, Vol.21 (1), p.74-74, Article 74
2020
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Epigenetic Modifications Unlock the Milk Protein Gene Loci during Mouse Mammary Gland Development and Differentiation
PloS one, 2013-01, Vol.8 (1), p.e53270-e53270
2013
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Association of Diet and Antimicrobial Resistance in Healthy U.S. Adults
mBio, 2022-05, Vol.13 (3), p.e0010122-e0010122
2022
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The collaborative effect of scientific meetings: A study of the International Milk Genomics Consortium
PloS one, 2018-08, Vol.13 (8), p.e0201637-e0201637
2018
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Surveying Nutrient Assessment with Photographs of Meals (SNAPMe): A Benchmark Dataset of Food Photos for Dietary Assessment
Nutrients, 2023-11, Vol.15 (23), p.4972
2023
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Genome-wide identification of peroxisome proliferator response elements using integrated computational genomics
Journal of lipid research, 2006-07, Vol.47 (7), p.1583-1587
2006
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No Associations between Dairy Intake and Markers of Gastrointestinal Inflammation in Healthy Adult Cohort
Nutrients, 2023-08, Vol.15 (16), p.3504
2023
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Saturated and Polyunsaturated Fatty Acids Reciprocally Modulate Dendritic Cell Functions Mediated through TLR4
The Journal of immunology (1950), 2005-05, Vol.174 (9), p.5390-5397
2005
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Association of Lactase Persistence Genotypes (rs4988235) and Ethnicity with Dairy Intake in a Healthy U.S. Population
Nutrients, 2019-08, Vol.11 (8), p.1860
2019
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Association of the Lactase Persistence Haplotype Block With Disease Risk in Populations of European Descent
Frontiers in genetics, 2020-10, Vol.11, p.558762-558762
2020
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From Genes to Milk: Genomic Organization and Epigenetic Regulation of the Mammary Transcriptome
PloS one, 2013-09, Vol.8 (9), p.e75030-e75030
2013
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Infant age inversely correlates with gut carriage of resistance genes, reflecting modifications in microbial carbohydrate metabolism during early life
iMeta, 2024-04, Vol.3 (2), p.e169-n/a
2024
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Associations among Milk Microbiota, Milk Fatty Acids, Milk Glycans, and Inflammation from Lactating Holstein Cows
Microbiology spectrum, 2023-06, Vol.11 (3), p.e0402022-e0402022
2023
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Lower Diet Quality Associated with Subclinical Gastrointestinal Inflammation in Healthy United States Adults
The Journal of nutrition, 2024-04, Vol.154 (4), p.1449-1460
2024
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SAMSA: a comprehensive metatranscriptome analysis pipeline
BMC bioinformatics, 2016-09, Vol.17 (1), p.399-399, Article 399
2016
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Bifidobacteria grown on human milk oligosaccharides downregulate the expression of inflammation-related genes in Caco-2 cells
BMC microbiology, 2015-08, Vol.15 (1), p.172-172, Article 172
2015
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Unlocking the bovine genome
BMC genomics, 2009-04, Vol.10 (1), p.193-193
2009
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G-NEST: a gene neighborhood scoring tool to identify co-conserved, co-expressed genes
BMC bioinformatics, 2012-09, Vol.13 (1), p.253-253, Article 253
2012
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