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Driving Structure-Based Drug Discovery through Cosolvent Molecular Dynamics
Journal of medicinal chemistry, 2016-12, Vol.59 (23), p.10383-10399
2016
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Large-Scale Validation of Mixed-Solvent Simulations to Assess Hotspots at Protein–Protein Interaction Interfaces
Journal of chemical information and modeling, 2018-04, Vol.58 (4), p.784-793
2018
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Moving Beyond Active-Site Detection: MixMD Applied to Allosteric Systems
The journal of physical chemistry. B, 2016-08, Vol.120 (33), p.8685-8695
2016
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Free Energies and Entropies of Binding Sites Identified by MixMD Cosolvent Simulations
Journal of chemical information and modeling, 2019-05, Vol.59 (5), p.2035-2045
2019
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Combining Cloud-Based Free-Energy Calculations, Synthetically Aware Enumerations, and Goal-Directed Generative Machine Learning for Rapid Large-Scale Chemical Exploration and Optimization
Journal of chemical information and modeling, 2020-09, Vol.60 (9), p.4311-4325
2020
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Reliable and Accurate Solution to the Induced Fit Docking Problem for Protein–Ligand Binding
Journal of chemical theory and computation, 2021-04, Vol.17 (4), p.2630-2639
2021
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Driving Structure-Based Drug Discovery through Cosolvent Molecular Dynamics: Miniperspective
Journal of medicinal chemistry, 2016-12, Vol.59 (23), p.10383-10399
2016
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Comparing pharmacophore models derived from crystallography and NMR ensembles
Journal of computer-aided molecular design, 2017-11, Vol.31 (11), p.979-993
2017
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Discovery of a Potent and Selective Tyrosine Kinase 2 Inhibitor: TAK-279
Journal of medicinal chemistry, 2023-08, Vol.66 (15), p.10473-10496
2023
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Abstract 1277: Discovery of novel CDC7 inhibitors that disrupt cell cycle dynamics and show anti-proliferative effects in cancer cells
Cancer research (Chicago, Ill.), 2021-07, Vol.81 (13_Supplement), p.1277-1277
2021
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Chemical validation of a druggable site on Hsp27/HSPB1 using in silico solvent mapping and biophysical methods
Bioorganic & medicinal chemistry, 2021-03, Vol.34, p.115990-115990, Article 115990
2021
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Identifying Binding Hot Spots on Protein Surfaces by Mixed-Solvent MD: HIV-1 Protease as a Test Case
Biopolymers, 2016-01, Vol.105 (1), p.21-34
2016
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