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Detecting Toxicity Pathways with a Formal Framework Based on Equilibrium Changes
Computational Methods in Systems Biology, p.196-213
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Strong Turing Completeness of Continuous Chemical Reaction Networks and Compilation of Mixed Analog-Digital Programs
Computational Methods in Systems Biology, p.108-127
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Pint: A Static Analyzer for Transient Dynamics of Qualitative Networks with IPython Interface
Computational Methods in Systems Biology, p.309-316
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Methods to Expand Cell Signaling Models Using Automated Reading and Model Checking
Computational Methods in Systems Biology, p.145-159
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KaDE: A Tool to Compile Kappa Rules into (Reduced) ODE Models
Computational Methods in Systems Biology, p.291-299
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Temporal Reprogramming of Boolean Networks
Computational Methods in Systems Biology, p.179-195
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Probably Approximately Correct Learning of Regulatory Networks from Time-Series Data
Computational Methods in Systems Biology, p.74-90
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Database of Dynamic Signatures Generated by Regulatory Networks (DSGRN)
Computational Methods in Systems Biology, p.300-308
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Bio-Curation for Cellular Signalling: The KAMI Project
Computational Methods in Systems Biology, p.3-19
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Detecting Attractors in Biological Models with Uncertain Parameters
Computational Methods in Systems Biology, p.40-56
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Automated Property Synthesis of ODEs Based Bio-pathways Models
Computational Methods in Systems Biology, p.265-282
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A Scheme for Adaptive Selection of Population Sizes in Approximate Bayesian Computation - Sequential Monte Carlo
Computational Methods in Systems Biology, p.128-144
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Explaining Response to Drugs Using Pathway Logic
Computational Methods in Systems Biology, p.249-264
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Graph Representations of Monotonic Boolean Model Pools
Computational Methods in Systems Biology, p.233-248
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TransferEntropyPT: An R Package to Assess Transfer Entropies via Permutation Tests
Computational Methods in Systems Biology, p.285-290
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Data-Driven Robust Control for Type 1 Diabetes Under Meal and Exercise Uncertainties
Computational Methods in Systems Biology, p.214-232
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Quantitative Regular Expressions for Arrhythmia Detection Algorithms
Computational Methods in Systems Biology, p.23-39
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Abduction Based Drug Target Discovery Using Boolean Control Network
Computational Methods in Systems Biology, p.57-73
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A Stochastic Model for the Formation of Spatial Methylation Patterns
Computational Methods in Systems Biology, p.160-178
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Rule-Based Modelling, Symmetries, Refinements
Formal Methods in Systems Biology, p.103-122
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Derivation of Qualitative Dynamical Models from Biochemical Networks
Computational Methods in Systems Biology, p.195-207
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