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Using transcription modules to identify expression clusters perturbed in Williams-Beuren syndrome
PLoS computational biology, 2011-01, Vol.7 (1), p.e1001054-e1001054
2011
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PlasClass improves plasmid sequence classification
PLoS computational biology, 2020-04, Vol.16 (4), p.e1007781-e1007781
2020
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Parameterized syncmer schemes improve long-read mapping
PLoS computational biology, 2022-10, Vol.18 (10), p.e1010638-e1010638
2022
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STDP and the distribution of preferred phases in the whisker system
PLoS computational biology, 2021-09, Vol.17 (9), p.e1009353-e1009353
2021
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Dissection of regulatory networks that are altered in disease via differential co-expression
PLoS computational biology, 2013-03, Vol.9 (3), p.e1002955-e1002955
2013
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Balancing feed-forward excitation and inhibition via Hebbian inhibitory synaptic plasticity
PLoS computational biology, 2012-01, Vol.8 (1), p.e1002334-e1002334
2012
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Oscillations via Spike-Timing Dependent Plasticity in a Feed-Forward Model
PLoS computational biology, 2016-04, Vol.12 (4), p.e1004878-e1004878
2016
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Designing small universal k-mer hitting sets for improved analysis of high-throughput sequencing
PLoS computational biology, 2017-10, Vol.13 (10), p.e1005777-e1005777
2017
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MONET: Multi-omic module discovery by omic selection
PLoS computational biology, 2020-09, Vol.16 (9), p.e1008182-e1008182
2020
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Extracting replicable associations across multiple studies: Empirical Bayes algorithms for controlling the false discovery rate
PLoS computational biology, 2017-08, Vol.13 (8), p.e1005700-e1005700
2017
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The temporal winner-take-all readout
PLoS computational biology, 2009-02, Vol.5 (2), p.e1000286-e1000286
2009
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Pattern recognition software and techniques for biological image analysis
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11), p.e1000974-e1000974
2010
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2018 ISCB accomplishments by a senior scientist award
PLoS computational biology, 2018-05, Vol.14 (5), p.e1006138-e1006138
2018
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2018 ISCB Overton Prize awarded to Cole Trapnell
PLoS computational biology, 2018-06, Vol.14 (6), p.e1006163-e1006163
2018
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2018 ISCB Innovator Award recognizes M. Madan Babu
PLoS computational biology, 2018-06, Vol.14 (6), p.e1006164-e1006164
2018
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2018 outstanding contributions to ISCB award: Russ Altman
PLoS computational biology, 2018-05, Vol.14 (5), p.e1006140-e1006140
2018
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Fast coding of orientation in primary visual cortex
PLoS computational biology, 2012-06, Vol.8 (6), p.e1002536-e1002536
2012
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The Temporal Winner-Take-All Readout: e1000286
PLoS computational biology, 2009-02, Vol.5 (2)
2009
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Representation of time-varying stimuli by a network exhibiting oscillations on a faster time scale
PLoS computational biology, 2009-05, Vol.5 (5), p.e1000370-e1000370
2009
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Coding "what" and "when" in the Archer fish retina
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11), p.e1000977-e1000977
2010
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Evolution and selection in yeast promoters: analyzing the combined effect of diverse transcription factor binding sites
PLoS computational biology, 2008-01, Vol.4 (1), p.e7-e7
2008
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Coding "What" and "When" in the Archer Fish Retina: e1000977
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11)
2010
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Representation of Time-Varying Stimuli by a Network Exhibiting Oscillations on a Faster Time Scale: e1000370
PLoS computational biology, 2009-05, Vol.5 (5)
2009
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Pattern Recognition Software and Techniques for Biological Image Analysis: e1000974
PLoS computational biology, 2010-11, Vol.6 (11)
2010
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