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Whole genome sequencing Mycobacterium tuberculosis directly from sputum identifies more genetic diversity than sequencing from culture

BMC genomics, 2019-05, Vol.20 (1), p.389-389, Article 389

2019

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Longitudinal assessment of sputum microbiome by sequencing of the 16S rRNA gene in non-cystic fibrosis bronchiectasis patients

PloS one, 2017-02, Vol.12 (2), p.e0170622-e0170622

2017

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Sputum lipoarabinomannan (LAM) as a biomarker to determine sputum mycobacterial load: exploratory and model-based analyses of integrated data from four cohorts

BMC infectious diseases, 2022-04, Vol.22 (1), p.327-327, Article 327

2022

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An optimized method for purifying, detecting and quantifying Mycobacterium tuberculosis RNA from sputum for monitoring treatment response in TB patients

Scientific reports, 2022-10, Vol.12 (1), p.17382-17382, Article 17382

2022

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Multi-Excitation Raman Spectroscopy for Label-Free, Strain-Level Characterization of Bacterial Pathogens in Artificial Sputum Media

Analytical chemistry (Washington), 2022-01, Vol.94 (2), p.669-677

2022

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Systematic Review of Pooling Sputum as an Efficient Method for Xpert MTB/RIF Tuberculosis Testing during the COVID-19 Pandemic

Emerging infectious diseases, 2021-03, Vol.27 (3), p.719-727

2021

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Sputum smear microscopy in the Xpert ® MTB/RIF era

The international journal of tuberculosis and lung disease, 2019-01, Vol.23 (1), p.12

2019

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Sputum Bacterial and Fungal Dynamics during Exacerbations of Severe COPD

PloS one, 2015-07, Vol.10 (7), p.e0130736-e0130736

2015

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Direct sampling of cystic fibrosis lungs indicates that DNA-based analyses of upper-airway specimens can misrepresent lung microbiota

Proceedings of the National Academy of Sciences - PNAS, 2012-08, Vol.109 (34), p.13769-13774

2012

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Comparison of sputum induction and bronchoscopy in diagnosis of sputum smear-negative pulmonary tuberculosis: a systemic review and meta-analysis

BMC pulmonary medicine, 2020-05, Vol.20 (1), p.146-146, Article 146

2020

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Microbiology sampling in non-cystic fibrosis bronchiectasis cases from northern Alberta

PloS one, 2023-07, Vol.18 (7), p.e0288704-e0288704

2023

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The adult cystic fibrosis airway microbiota is stable over time and infection type, and highly resilient to antibiotic treatment of exacerbations

PloS one, 2012-09, Vol.7 (9), p.e45001

2012

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Direct Molecular Detection of Drug-Resistant Tuberculosis from Transported Bio-Safe Dried Sputum on Filter-Paper

Current microbiology, 2022-04, Vol.79 (4), p.110-110, Article 110

2022

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A Mycobacterium tuberculosis fingerprint in human breath allows tuberculosis detection

Nature communications, 2022-12, Vol.13 (1), p.7751-7751

2022

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Ex-vivo RNA expression analysis of vaccine candidate genes in COPD sputum samples

Respiratory research, 2023-10, Vol.24 (1), p.243-243, Article 243

2023

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Rapid 16S rRNA next-generation sequencing of polymicrobial clinical samples for diagnosis of complex bacterial infections

PloS one, 2013-05, Vol.8 (5), p.e65226-e65226

2013

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Blood mRNA biomarkers distinguish variable systemic and sputum inflammation at treatment initiation of inhaled antibiotics in cystic fibrosis: A prospective non-randomized trial

PloS one, 2022-05, Vol.17 (5), p.e0267592-e0267592

2022

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Mycobacterium avium Complex: Addressing Gaps in Diagnosis and Management

The Journal of infectious diseases, 2020-08, Vol.222 (Supplement_4), p.S199-S211

2020

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Molecular detection of multiple emerging pathogens in sputa from cystic fibrosis patients

PloS one, 2008-08, Vol.3 (8), p.e2908-e2908

2008

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Improved culture detection of Staphylococcus aureus from sputum of patients with cystic fibrosis (CF)

Journal of clinical pathology, 2019-12, Vol.72 (12), p.837

2019

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The within-host population dynamics of Mycobacterium tuberculosis vary with treatment efficacy

Genome Biology, 2017-04, Vol.18 (1), p.71-71, Article 71

2017

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Association of bacterial community types, functional microbial processes and lung disease in cystic fibrosis airways

The ISME Journal, 2022-04, Vol.16 (4), p.905-914

2022

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Pharmacokinetic/pharmacodynamic analysis of high‐dose tigecycline, by Monte Carlo simulation, in plasma and sputum of patients with hospital‐acquired pneumonia

Journal of clinical pharmacy and therapeutics, 2022-12, Vol.47 (12), p.2312-2319

2022

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From Bench to Clinic: A Nitroreductase Rv3368c-Responsive Cyanine-Based Probe for the Specific Detection of Live Mycobacterium tuberculosis

Analytical chemistry (Washington), 2024-01, Vol.96 (4), p.1576-1586

2024

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Alcohol drinking delays the rate of sputum smear conversion among DR-TB patients in northwest Ethiopia; A retrospective follow-up study

PloS one, 2022-03, Vol.17 (3), p.e0264852-e0264852

2022

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