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Genome Detective: an automated system for virus identification from high-throughput sequencing data
Bioinformatics, 2019-03, Vol.35 (5), p.871-873
2019
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Overview of Virus Metagenomic Classification Methods and Their Biological Applications
Frontiers in microbiology, 2018-04, Vol.9, p.749-749
2018
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Fecal Microbiota Transplantation Influences Procarcinogenic Escherichia coli in Recipient Recurrent Clostridioides difficile Patients
Gastroenterology (New York, N.Y. 1943), 2021-10, Vol.161 (4), p.1218-1228.e5
2021
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Enrichment of colibactin-associated mutational signatures in unexplained colorectal polyposis patients
BMC cancer, 2024-01, Vol.24 (1), p.104-104, Article 104
2024
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Long-term beneficial effect of faecal microbiota transplantation on colonisation of multidrug-resistant bacteria and resistome abundance in patients with recurrent Clostridioides difficile infection
Genome medicine, 2024-02, Vol.16 (1), p.37-16, Article 37
2024
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Microbiota-associated risk factors for asymptomatic gut colonisation with multi-drug-resistant organisms in a Dutch nursing home
Genome medicine, 2021-04, Vol.13 (1), p.54-54, Article 54
2021
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Reply
Gastroenterology (New York, N.Y. 1943), 2022-03, Vol.162 (3), p.994-995
2022
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Reply
Gastroenterology (New York, N.Y. 1943), 2022-03, Vol.162 (3), p.994
2022
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Reply
Gastroenterology (New York, N.Y. 1943), 2022-03, Vol.162 (3), p.994-995
2022
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Haem is crucial for medium-dependent metronidazole resistance in clinical isolates of Clostridioides difficile
Journal of antimicrobial chemotherapy, 2021-07, Vol.76 (7), p.1731-1740
2021
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Periodic screening of donor faeces with a quarantine period to prevent transmission of multidrug-resistant organisms during faecal microbiota transplantation: a retrospective cohort study
The Lancet infectious diseases, 2021-05, Vol.21 (5), p.711-721
2021
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Fecal Microbiota Transplantation engraftment after budesonide or placebo in patients with active ulcerative colitis using pre-selected donors: a randomized pilot study
Journal of Crohn's and colitis, 2024-04
2024
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A64 Overview of virus metagenomics classification tools
Virus evolution, 2018-04, Vol.4 (suppl_1)
2018
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Gut colonisation by extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli and its association with the gut microbiome and metabolome in Dutch adults: a matched case-control study
The Lancet. Microbe, 2022-06, Vol.3 (6), p.e443-e451
2022
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A34 Automated profiling of the human virome from raw metagenomic data
Virus evolution, 2017-03, Vol.3 (suppl_1)
2017
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Medieval Multilingual Manuscripts: Case Studies from Ireland to Japan
1, 2022
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BIO-SAFE: a method for evaluation of biodiversity values on the basis of political and legal criteria
Landscape and urban planning, 2001-07, Vol.55 (2), p.121-137
2001
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