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eggNOG v4.0: nested orthology inference across 3686 organisms
Nucleic acids research, 2014-01, Vol.42 (Database issue), p.D231-D239
2014
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Human tRNAs with inosine 34 are essential to efficiently translate eukarya-specific low-complexity proteins
Nucleic acids research, 2021-07, Vol.49 (12), p.7011-7034
2021
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MetaPhOrs 2.0: integrative, phylogeny-based inference of orthology and paralogy across the tree of life
Nucleic acids research, 2020-07, Vol.48 (W1), p.W553-W557
2020
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MetaPhOrs: orthology and paralogy predictions from multiple phylogenetic evidence using a consistency-based confidence score
Nucleic acids research, 2011-03, Vol.39 (5), p.e32-e32
2011
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PeroxisomeDB 2.0: an integrative view of the global peroxisomal metabolome
Nucleic acids research, 2010-01, Vol.38 (Database issue), p.D800-D805
2010
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PeroxisomeDB: a database for the peroxisomal proteome, functional genomics and disease
Nucleic acids research, 2007-01, Vol.35 (Database issue), p.D815-D822
2007
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Phylemon 2.0: a suite of web-tools for molecular evolution, phylogenetics, phylogenomics and hypotheses testing
Nucleic acids research, 2011-07, Vol.39 (Web Server issue), p.W470-W474
2011
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Phylemon: a suite of web tools for molecular evolution, phylogenetics and phylogenomics
Nucleic acids research, 2007-07, Vol.35 (Web Server issue), p.W38-W42
2007
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A phylogenomics approach for selecting robust sets of phylogenetic markers
Nucleic acids research, 2014-04, Vol.42 (7), p.e54-e54
2014
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PhylomeDB: a database for genome-wide collections of gene phylogenies
Nucleic acids research, 2008-01, Vol.36 (Database issue), p.D491-D496
2008
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PhylomeDB v4: zooming into the plurality of evolutionary histories of a genome
Nucleic acids research, 2014-01, Vol.42 (Database issue), p.D897-D902
2014
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PhylomeDB V5: an expanding repository for genome-wide catalogues of annotated gene phylogenies
Nucleic acids research, 2022-01, Vol.50 (D1), p.D1062-D1068
2022
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The Quest for Orthologs orthology benchmark service in 2022
Nucleic acids research, 2022-07, Vol.50 (W1), p.W623-W632
2022
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Redundans: an assembly pipeline for highly heterozygous genomes
Nucleic acids research, 2016-07, Vol.44 (12), p.e113-e113
2016
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spongeScan: A web for detecting microRNA binding elements in lncRNA sequences
Nucleic acids research, 2016-07, Vol.44 (W1), p.W176-W180
2016
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TreeKO: a duplication-aware algorithm for the comparison of phylogenetic trees
Nucleic acids research, 2011-05, Vol.39 (10), p.e66-e66
2011
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