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Genoviz Software Development Kit: Java tool kit for building genomics visualization applications
BMC bioinformatics, 2009-08, Vol.10 (1), p.266-266, Article 266
2009
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FMAj: a tool for high content analysis of muscle dynamics in Drosophila metamorphosis
BMC bioinformatics, 2014, Vol.15 Suppl 16 (Suppl 16), p.S6-S6, Article S6
2014
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WaveletQuant, an improved quantification software based on wavelet signal threshold de-noising for labeled quantitative proteomic analysis
BMC bioinformatics, 2010-04, Vol.11 (1), p.219-219, Article 219
2010
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NODeJ: an ImageJ plugin for 3D segmentation of nuclear objects
BMC bioinformatics, 2022-06, Vol.23 (1), p.216-216, Article 216
2022
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Data exploration tools for the Gene Ontology database
Bioinformatics, 2004-12, Vol.20 (18), p.3442-3454
2004
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A global view of standards for open image data formats and repositories
Nature methods, 2021-12, Vol.18 (12), p.1440
2021
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BLASTGrabber: a bioinformatic tool for visualization, analysis and sequence selection of massive BLAST data
BMC bioinformatics, 2014-05, Vol.15 (1), p.128-128, Article 128
2014
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Identification of key player genes in gene regulatory networks
BMC systems biology, 2016-09, Vol.10 (1), p.88-88, Article 88
2016
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Pathway collages: personalized multi-pathway diagrams
BMC bioinformatics, 2016-12, Vol.17 (1), p.529-529, Article 529
2016
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Metabolite Changes in Indonesian Tempe Production from Raw Soybeans to Over-Fermented Tempe
Metabolites, 2023-02, Vol.13 (2), p.300
2023
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QUADrATiC: scalable gene expression connectivity mapping for repurposing FDA-approved therapeutics
BMC bioinformatics, 2016-05, Vol.17 (1), p.198-198, Article 198
2016
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RNAexinv: An extended inverse RNA folding from shape and physical attributes to sequences
BMC bioinformatics, 2011-08, Vol.12 (1), p.319-319, Article 319
2011
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A Transcriptomic Analysis of T98G Human Glioblastoma Cells after Exposure to Cadmium-Selenium Quantum Dots Mainly Reveals Alterations in Neuroinflammation Processes and Hypothalamus Regulation
International journal of molecular sciences, 2022-02, Vol.23 (4), p.2267
2022
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Assessing the significance of conserved genomic aberrations using high resolution genomic microarrays
PLoS genetics, 2007-08, Vol.3 (8), p.e143-e143
2007
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Quality control, analysis and secure sharing of Luminex® immunoassay data using the open source LabKey Server platform
BMC bioinformatics, 2013-04, Vol.14 (1), p.145-145, Article 145
2013
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The Risa R/Bioconductor package: integrative data analysis from experimental metadata and back again
BMC bioinformatics, 2014, Vol.15 Suppl 1 (Suppl 1), p.S11-S11, Article S11
2014
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Fast, scalable generation of high‐quality protein multiple sequence alignments using Clustal Omega
Molecular systems biology, 2011-10, Vol.7 (1), p.539-n/a
2011
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Populous: a tool for building OWL ontologies from templates
BMC bioinformatics, 2012-01, Vol.13 Suppl 1 (Suppl 1), p.S5-S5, Article S5
2012
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An XML transfer schema for exchange of genomic and genetic mapping data: implementation as a web service in a Taverna workflow
BMC bioinformatics, 2009-08, Vol.10 (1), p.252-252, Article 252
2009
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XperimentR: painless annotation of a biological experiment for the laboratory scientist
BMC bioinformatics, 2013-01, Vol.14 (1), p.8-8, Article 8
2013
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Quality of computationally inferred gene ontology annotations
PLoS computational biology, 2012-05, Vol.8 (5), p.e1002533-e1002533
2012
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Evaluation of reference genes for real-time quantitative PCR studies in Candida glabrata following azole treatment
BMC molecular biology, 2012-06, Vol.13 (1), p.22-22
2012
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A realistic assessment of methods for extracting gene/protein interactions from free text
BMC bioinformatics, 2009-07, Vol.10 (1), p.233-233, Article 233
2009
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Condor-COPASI: high-throughput computing for biochemical networks
BMC systems biology, 2012-07, Vol.6 (1), p.91-91, Article 91
2012
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Adaptive informatics for multifactorial and high-content biological data
Nature methods, 2011-06, Vol.8 (6), p.487
2011
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