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BigDataProcessor2: a free and open-source Fiji plugin for inspection and processing of TB sized image data
Bioinformatics (Oxford, England), 2021-09, Vol.37 (18), p.3079-3081
2021
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High-complexity regions in mammalian genomes are enriched for developmental genes
Bioinformatics (Oxford, England), 2019-06, Vol.35 (11), p.1813-1819
2019
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CALQ: compression of quality values of aligned sequencing data
Bioinformatics, 2018-05, Vol.34 (10), p.1650-1658
2018
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Exhaustively characterizing feasible logic models of a signaling network using Answer Set Programming
Bioinformatics, 2013-09, Vol.29 (18), p.2320-2326
2013
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Long read alignment based on maximal exact match seeds
Bioinformatics, 2012-09, Vol.28 (18), p.i318-i324
2012
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LocTree2 predicts localization for all domains of life
Bioinformatics, 2012-09, Vol.28 (18), p.i458-i465
2012
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SNPdbe: constructing an nsSNP functional impacts database
Bioinformatics, 2012-02, Vol.28 (4), p.601-602
2012
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Classification of ncRNAs using position and size information in deep sequencing data
Bioinformatics, 2010-09, Vol.26 (18), p.i426-i432
2010
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Pitfalls of supervised feature selection
Bioinformatics, 2010-02, Vol.26 (3), p.440-443
2010
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SHREC: a short-read error correction method
Bioinformatics, 2009-09, Vol.25 (17), p.2157-2163
2009
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Lightweight comparison of RNAs based on exact sequence–structure matches
Bioinformatics, 2009-08, Vol.25 (16), p.2095-2102
2009
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Identifying the topology of protein complexes from affinity purification assays
Bioinformatics, 2009-08, Vol.25 (16), p.2140-2146
2009
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A consistency-based consensus algorithm for de novo and reference-guided sequence assembly of short reads
Bioinformatics, 2009-05, Vol.25 (9), p.1118-1124
2009
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  • BibTeX
Retention time alignment algorithms for LC/MS data must consider non-linear shifts
Bioinformatics, 2009-03, Vol.25 (6), p.758-764
2009
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  • BibTeX
Estimating large-scale signaling networks through nested effect models with intervention effects from microarray data
Bioinformatics, 2008-11, Vol.24 (22), p.2650-2656
2008
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  • BibTeX
ProCope—protein complex prediction and evaluation
Bioinformatics, 2008-09, Vol.24 (18), p.2115-2116
2008
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Segment-based multiple sequence alignment
Bioinformatics, 2008-08, Vol.24 (16), p.i187-i192
2008
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  • BibTeX
Sparse kernel methods for high-dimensional survival data
Bioinformatics, 2008-07, Vol.24 (14), p.1632-1638
2008
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Computational epigenetics
Bioinformatics, 2008-01, Vol.24 (1), p.1-10
2008
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Conformational analysis of alternative protein structures
Bioinformatics, 2007-12, Vol.23 (23), p.3131-3138
2007
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PepSplice: cache-efficient search algorithms for comprehensive identification of tandem mass spectra
Bioinformatics, 2007-11, Vol.23 (22), p.3016-3023
2007
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  • BibTeX
PhylArray: phylogenetic probe design algorithm for microarray
Bioinformatics, 2007-10, Vol.23 (19), p.2550-2557
2007
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  • BibTeX
Simple and fast alignment of metabolic pathways by exploiting local diversity
Bioinformatics, 2007-08, Vol.23 (15), p.1978-1985
2007
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  • BibTeX
Fast model-based protein homology detection without alignment
Bioinformatics, 2007-07, Vol.23 (14), p.1728-1736
2007
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Faspad: fast signaling pathway detection
Bioinformatics, 2007-07, Vol.23 (13), p.1708-1709
2007
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