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Shotgun cloning of transposon insertions in the genome of Caenorhabditis elegans
Comparative and functional genomics, 2004-04, Vol.5 (3), p.225-229
van der Linden, Alexander M.
Plasterk, Ronald H. A.
2004
Volltextzugriff (PDF)
Details
Autor(en) / Beteiligte
van der Linden, Alexander M.
Plasterk, Ronald H. A.
Titel
Shotgun cloning of transposon insertions in the genome of Caenorhabditis elegans
Ist Teil von
Comparative and functional genomics, 2004-04, Vol.5 (3), p.225-229
Ort / Verlag
Chichester, UK: John Wiley & Sons, Ltd
Erscheinungsjahr
2004
Beschreibungen/Notizen
We present a strategy to identify and map large numbers of transposon insertions in the genome of Caenorhabditis elegans. Our approach makes use of the mutator strain mut‐7, which has germline‐transposition activity of the Tc1/mariner family of transposons, a display protocol to detect new transposon insertions, and the availability of the genomic sequence of C. elegans. From a pilot insertional mutagenesis screen, we have obtained 351 new Tc1 transposons inserted in or near 219 predicted C. elegans genes. The strategy presented provides an approach to isolate insertions of natural transposable elements in many C. elegans genes and to create a large‐scale collection of C. elegans mutants. Copyright © 2004 John Wiley & Sons, Ltd.
Sprache
Englisch
Identifikatoren
ISSN: 1531-6912
eISSN: 1532-6268
DOI: 10.1002/cfg.392
Titel-ID: cdi_pubmedcentral_primary_oai_pubmedcentral_nih_gov_2447444
Format
–
Schlagworte
Biological and medical sciences
,
Caenorhabditis elegans
,
Fundamental and applied biological sciences. Psychology
,
insertional mutagenesis screen
,
Molecular and cellular biology
,
Molecular genetics
,
mut-7
,
Tc1
,
transposon insertion display protocol
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