Details

Autor(en) / Beteiligte

• Bayona, Leonor Garcia
• Grajales, Alejandro
• Cardenas, Martha Emiliana
• Sierra, Roberto
• Lozano, Gabriel
• Garavito, Manuel Fernando
• Garcia, Maria Caridad Cepero de
• Bernal, Adriana
• Jimenez, Pedro
• Restrepo, Silvia

Titel

Isolation and characterization of two strains of Fusarium oxysporum causing potato dry rot in Solanum tuberosum in Colombia

Ist Teil von

• Revista iberoamericana de micología, 2011-12, Vol.28 (4), p.166-172

Erscheinungsjahr

2011

Quelle

Free E-Journal (出版社公開部分のみ）

Beschreibungen/Notizen

• Background: Fusarium oxysporum has worldwide distribution and causes severe vascular wilt or root rot in many plants. Strains are classified into formae speciales based on their high degree of host specificity, of which multilocus sequence typing provides a fairly good estimate. Aims: The main aim of this study was to identify the causal agent of an infected potato tuber in Colombia. Methods: Two F. oxysporum isolates were recovered from a potato tuber showing symptoms of dry rot. Both macroscopic and microscopic morphology differences were observed between the two isolates. Koch's postulates were verified and in quantitative tuber pathogenecity trials, both isolates induced moderate dry rot. Ribosomal internal transcribed spacer (ITS) and partial intergenic spacer region (IGS) sequences were PCR-amplified, sequenced and shown to be identical for the two isolates. A maximum parsimony phylogeny was created using F. oxysporum IGS sequences available in the Genebank database, which does not include sequences from the formae speciales tuberosi. Results: Our two isolates were most closely related to a red clover (Trifolium pratense) pathogenic isolate and two non-pathogenic F. oxysporum isolates from birdsfoot trefoil (Lotus corniculatus) and Lycopersicon sp. rhyzosphere (99% identity). Conclusions: These experiments showed that our isolates are not restricted to potato and that a molecular marker is needed to differentiate the formae speciales since the IGS and EF-1[alpha] do not have the power to do it.Original Abstract: Antecedentes: Fusarium oxysporum tiene distribucion mundial y causa en varias plantas el marchitamiento vascular severo o la pudricion de la raiz. Las cepas se clasifican en formae speciales basandose en su alto grado de especificidad por un hospedero. Se puede obtener una muy buena estimacion de esta por medio de la tipificacion con secuencia de multiples locus. Objetivos: El objetivo principal de este estudio consistio en la identificacion del agente causal de un tuberculo infectado en Colombia. Metodos: Dos aislados diferentes de F. oxysporum se recuperaron a partir de un tuberculo de papa que mostraba sintomas de pudricion seca. Se observaron diferencias tanto macroscopicas como microscopicas entre los aislamientos. Se verificaron los postulados de Koch y al llevar a cabo ensayos cuantitativos de patogenicidad, ambos aislamientos produjeron los sintomas de la pudricion seca. Se amplificaron por PCR y se secuenciaron regiones del espaciador interno transcrito (ITS) y el espaciador intergenico (IGS) ribosomico. Resultados: Las secuencias obtenidas fueron identicas entre los dos aislamientos. Se reconstruyo una filogenia por maxima parsimonia con las secuencias de IGS disponibles en la base de datos de GenBank, que no incluye secuencias de la forma specialis tuberosi. Nuestros dos aislamientos mostraron estar mas cercanamente relacionados con un aislamiento patogenico de trebol rojo (Trifolium pratense) y dos aislamientos no patogenicos de Lotus corniculatus y la rizosfera de Lycopersicon sp. (99% identidad). Conclusiones: Estos experimentos demuestran que los aislamientos obtenidos no solo son capaces de afectar a la patata y que se requiere un marcador molecular que permita delimitar las formas especiales ya que ni el IGS ni el EF-1[alpha] tienen el poder de resolucion suficiente para hacerlo.