Details

Autor(en) / Beteiligte

• Li, Jiangning
• Adams, Larry
• Schwartz, S.M
• Bumgarner, Roger E

Titel

RNA amplification, fidelity and reproducibility of expression profiling

Ist Teil von

• Comptes rendus. Biologies, 2003-10, Vol.326 (10), p.1021-1030

Ort / Verlag

France: Elsevier SAS

Erscheinungsjahr

2003

Quelle

Free E-Journal (出版社公開部分のみ）

Beschreibungen/Notizen

• We quantitatively address the effect of T7 RNA amplification on expression profiling data, and answer the following questions: (1) What fraction of genes sampled is amplified non-linearly? (2) What is the effect of RNA amplification on comparative expression measurements? (3) If there is amplification bias, is the bias dependent on the degree of amplification or the amount of starting material and (4) Does amplification increase the overall variability of the results? We show that while there is significant amplification bias, the bias is consistent and generally has little effect on array comparisons between amplified samples. To cite this article: J. Li et al., C. R. Biologies 326 (2003). L'effet de l'amplification de l'ARN par l'ARN polymérase de T7 sur les données de profils d'expression a été étudié quantitativement pour répondre aux questions suivantes : (1) Quelle fraction des gènes échantillonnés est-elle amplifiée de manière linéaire ? (2) Quel est l'effet de l'amplification de l'ARN sur les mesures comparatives d'expression ? (3) S'il y a un biais d'amplification, est-il dépendant du degré d'amplification ou de la quantité de matériel de départ ? (4) L'amplification augmente-t-elle la variabilité globale des résultats ? Bien qu'il existe un biais significatif, il est reproductible et a en général peu d'effet sur les comparaisons entre échantillons amplifiés. Pour citer cet article : J. Li et al., C. R. Biologies 326 (2003).