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Rapid and accurate typing of Bordetella pertussis targeting genes encoding acellular vaccine antigens using real time PCR and High Resolution Melt analysis
Ist Teil von
Journal of microbiological methods, 2009-06, Vol.77 (3), p.326-329
Ort / Verlag
Amsterdam: Elsevier B.V
Erscheinungsjahr
2009
Quelle
MEDLINE
Beschreibungen/Notizen
Real Time-PCR (RT-PCR) and high resolution melt (HRM) analyses were used for rapid typing of genes encoding components of the pertussis acellular vaccine, namely
prn,
ptxA,
fhaB, fim2 and
fim3. The length polymorphisms in
prn were detected by RT-PCR followed by HRM; single nucleotide polymorphisms in
prn and other genes were detected by hairpin primer RT-PCR. These rapid methods are suitable for large-scale studies of vaccine-driven evolution of
Bordetella pertussis.