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Details

Autor(en) / Beteiligte
Titel
Macrococcus canis and M. caseolyticus in dogs: occurrence, genetic diversity and antibiotic resistance
Ist Teil von
  • Veterinary dermatology, 2017-12, Vol.28 (6), p.559-e133
Ort / Verlag
England
Erscheinungsjahr
2017
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Quelle
MEDLINE
Beschreibungen/Notizen
  • Background The discovery of a new Macrococcus canis species isolated from skin and infection sites of dogs led us to question if Macrococcus spp. are common in dogs and are resistant to antibiotics. Hypothesis/Objectives To evaluate the occurrence of Macrococcus spp. in dogs, determine antibiotic resistance profiles and genetic relationships. Animals One hundred and sixty two dogs (mainly West Highland white terriers and Newfoundland dogs) were screened for the presence of Macrococcus, including six dogs with Macrococcus infections. Methods Samples were taken from skin, ear canal and oral mucosa using swabs. Macrococci were identified by matrix‐assisted laser desorption ionization‐time of flight mass spectrometry, 16S rRNA sequencing and nuc‐PCR. Minimal inhibitory concentrations of 19 antibiotics were determined using broth microdilution. Resistance mechanisms were identified by microarray and sequencing of the fluoroquinolone‐determining region of gyrA and grlA. Sequence type (ST) was determined by multilocus sequence typing. Results Out of the 162 dogs, six harboured M. caseolyticus (n = 6) and 13 harboured M. canis (n = 16). Six isolates of M. canis and one of M. caseolyticus were obtained from infection sites. The 22 M. canis strains belonged to 20 different STs and the seven M. caseolyticus strains to three STs. Resistance to antibiotics was mostly associated with the detection of known genes, with mecB‐mediated meticillin resistance being the most frequent. Conclusion and clinical importance This study gives some insights into the occurrence and genetic characteristics of antibiotic‐resistant Macrococcus from dogs. Presence of M. canis in infection sites and resistance to antibiotics emphasized that more attention should be paid to this novel bacteria species. Résumé Contexte La découverte des nouvelles espèces de Macrococcus canis isolées de la peau et des sites d'infection des chiens laisse à penser que Macrococcus spp. est fréquent chez le chien et résistant aux antibiotiques. Hypothèses/Objectifs Evaluer l'occurrence de Macroccocus spp. chez le chien, déterminer les profils de résistance aux antibiotiques et les liens génétiques. Sujets Cent soixante‐deux chiens (principalement des West Highland white terriers et de Terre‐neuve) ont été prélevé pour la détection de Macrococcus y compris, six chiens atteints d'infection à Macrococcus. Méthodes Des échantillons ont été prélevés de la peau, des conduits auriculaires et de la muqueuse orale à l'aide d'écouvillons. Les Macrococci ont été identifiés par spectrométrie de masse à temps de vol, séquençage de ARNr 16S et PCR‐nuc. Les concentrations minimales inhibitrices de 19 antibiotiques ont été déterminées par microdilution en milieu liquide. Les mécanismes de résistance ont été identifiés par puce à ADN et séquençage de région déterminant les fluoroquinolones de gyrA et grlA. Le type de séquence (ST) a été déterminé par ST multilocus. Résultats Sur les 162 chiens, six ont présenté M. caseolyticus (n = 6) et 13, M. canis (n = 16). Six souches de M. canis et une de M. caseolyticus ont été obtenues des sites d'infection. Les 22 souches de M. canis appartenant à 20 différentes ST et les sept souches de M. caseolyticus à trois ST. La résistance aux antibiotiques était principalement associée à la détection des gènes connus avec, le plus fréquemment, la résistance à la méticilline médiée par mecB. Conclusion et importance clinique Cette étude donne certains éléments sur l'occurrence et les caractéristiques génétiques de Macrococcus résistant aux antibiotiques chez le chien. La présence de M. canis sur les sites infectieux et la résistance aux antibiotiques montre que plus d'attention devrait être portée à ces nouvelles espèces bactériennes. Resumen Introducción El descubrimiento de una nueva especie de Macrococcus canis aislada de la piel y zonas de infección en perros nos llevó a preguntar si Macrococcus spp. son comunes en perros y si son resistentes a antibióticos. Hipótesis/Objetivos Evaluar la presencia de Macrococcus spp. en perros y determinar los perfiles de resistencia a antibióticos y relaciones genéticas. Animales Ciento sesenta y dos perros (principalmente de raza West Highland White Terrier y Terranova) fueron examinados por la presencia de Macrococcus, incluyendo seis perros con infecciones por Macrococcus. Métodos Se tomaron muestras de piel, conducto auditivo y mucosa oral usando hisopos. Se identificados Macrococci por la técnica de esdpectrometría de masas en tiempo de vuelo con desorción‐ionización por laser asistida en matriz, secuenciación de 16S rRNA y PCR de nuc. Se determinaron concentraciones inhibitorias mínimas para19 antibióticos usando microdilución en caldo. Los mecanismos de resistencia fueron identificados por microarrays y secuenciación de la región determinante de fluoroquinolona en gyrA y grlA. El tipo de secuencia (ST) se determinó por ST multilocus. Resultados De los 162 perros, seis presentaron M. caseolyticus (n = 6) y 13 M. canis (n = 16). Seis aislamientos de M. canis y uno de M. caseolyticus fueron obtenidos de zonas de infección. Las 22 cepas de M. canis pertenecían a 20 ST diferentes y las siete cepas de M. caseolyticus a tres STs. La resistencia a los antibióticos se asoció principalmente con la detección de genes conocidos, siendo la resistencia a meticilina mediada por mecB la más frecuente. Conclusión y importancia clínica Este estudio aporta nuevos datos sobre la presencia y las características genéticas de Macrococcus resistente a antibióticos en perros. La presencia de M. canis en los zonas de infección y la resistencia a antibióticos indica que se debe prestar más atención a esta nueva especie bacteriana. Zusammenfassung Hintergrund Die Entdeckung einer neuen Macrococcus canis Spezies, die von der Haut und aus Infektionsstellen von Hunden isoliert wurde, führte uns zur der Frage, ob Macrococcus spp. häufig bei Hunden vorkommt und Antibiotika gegenüber resistent ist. Hypothese/Ziele Eine Untersuchung über das Auftreten von Macrococcus spp. bei Hunden, deren Antibiotika Resistenzprofile und deren genetische Beziehungen. Tiere Einhundertzweiundsechzig Hunde (hauptsächlich West Highland White Terrier und Neufundländer) wurden auf das Auftreten von Macrococcus gescreent, wobei sechs Hunde mit Macrococcus Infektionen dabei waren. Methoden Mittels Tupfern wurden Proben von der Haut, dem Ohrkanal und der Mundschleimhaut genommen. Es wurden Macrokokken mittels Matrix unterstützter Laser Desorption Ionisierung im Flugzeitmassenspektrometer, sowie mittels 16S rRNA Sequenzierung und nuc‐PCR, identifiziert. Die minimale Hemmkonzentration der 19 Antibiotika wurde mittels Bouillon‐Mikrodilution bestimmt. Resistenzmechanismen wurden mittels Microarray und Sequenzierung der Fluoroquinolon‐bestimmenden Region von gyrA und grlA identifiziert. Der Sequenztyp (ST) wurde mittels Multilokus ST bestimmt. Ergebnisse Von den 162 Hunden trugen sechs M. caseolyticus (n=6) und 13 trugen M. canis (n=16). Sechs Isolate von M. canis und eines von M. caseolyticus stammten aus den Infektionsstellen. Die 22 M. canis Stämme gehörten zu 20 verschiedenen STs und die sieben M. caseolyticus Stämme zu drei STs. Antibiotika Resistenzen traten hauptsächlich im Zusammenhang mit der Entdeckung von bekannten Genen, wie mecB‐vermittelter Methicillin‐Resistenz als der häufigsten, auf. Schlussfolgerungen und klinische Bedeutung Diese Studie gibt einen Einblick in das Auftreten und die genetischen Charakteristika der Antibiotika‐resistenten Macrococcus von Hunden. Das Vorkommen von M. canis in Infektionsstellen und eine Resistenz zu Antibiotika unterstrich, dass dieser neuen Bakterienspezies größere Beachtung geschenkt werden sollte. 要約 背景 犬の皮膚および感染部位から分離された新規のMacrococcus canis種の発見により、Macrococcus sppが犬では一般的であり、抗生物質に耐性があるのではないかという疑問が生じた. 仮説/目的 犬におけるMacrococcus sppの発生頻度を調べ、抗生物質耐性プロファイルと遺伝的関係を決定すること. 供与動物 Macrococcus感染症の6頭を含む164頭の犬(主にウェスト・ハイランド・ホワイト・テリアとニューファンドランドドッグ)を対象に、Macrococcusの存在をスクリーニングした. 方法 綿棒を用いて、皮膚、外耳道および口腔粘膜からサンプルを採取した。Macrococciは、マトリックス支援レーザー脱離イオン化 ‐ 飛行時間型質量分析、16S rRNAシーケンシングおよびnuc‐PCRによって同定した。ブロス微量希釈を用いて、19種類の抗生物質の最小阻害濃度を決定した。耐性機序は、マイクロアレイおよびフルオロキノロン決定領域であるgyrAおよびgrlAのシーケンシングによって同定した。配列タイプ(ST)は、マルチフォーカスSTによって決定した. 結果 162頭の犬のうち6頭がM. caseolyticus(n = 6)を、13頭がM. canis(n = 16)を保有していた。M. canisの6つの分離株およびM. caseolyticの1つの分離株が感染部位から採取された。22のM. canis株は20種の異なるSTに属し、7つのM. caseolyticus株は3種のSTに属していた。抗生物質に対する耐性は、主に既知の遺伝子に関連しており、mecB介在性のメチシリン耐性が最も多かった. 結論および臨床的な重要性 本研究は、犬から検出された抗生物質耐性Macrococcusの発生率および遺伝的特徴について、いくつかの見識を与えるものである。感染部位におけるM. canisの存在および抗生物質耐性は、この新規細菌種にさらなる注意を払う必要性を示した. 摘要 背景 从犬的皮肤和感染部位分离获得一株新的犬巨球菌,这让我们不禁想了解,巨球菌在犬上是否很常见,并且对抗生素耐药. 假设/目的 评估犬巨球菌感染概况,判定其抗生素耐药性与遗传的关系. 动物 对162只犬(主要是西部高地白梗和纽芬兰犬)是否存在巨球菌进行筛查,其中有6只犬存在巨球菌感染. 方法 使用棉签,从皮肤、耳道和口腔黏膜处取样。通过基质辅助激光解吸电离‐飞行时间质谱法、16S rRNA测序和nuc基因‐PCR对巨球菌进行鉴定。使用肉汤微量稀释测定19种抗生素的最小抑制浓度。通过微阵列和gyrA和grlA基因氟喹诺酮耐药决定区的序列测定,鉴定其耐药机制。序列类型(ST)通过多位点ST确定. 结果 162只犬中,6只潜藏溶酪巨球菌(n=6),13只潜藏犬巨球菌(n=16)。从感染部位分离,获得6株犬巨球菌和1株溶酪巨球菌。22株犬巨球菌属于20个不同的序列类型,7株溶酪巨球菌属于3个序列类型。抗生素耐药性主要与已知基因的检测相关,最常见的是mecB介导的甲氧西林耐药. 结论和临床意义 本研究对犬巨球菌抗生素耐药性的产生及其遗传特性提出了新见解。犬巨球菌在感染部位的存在和抗生素耐药性的产生,提醒我们应更加留意这一新的细菌种类. Resumo Contexto A descoberta de uma nova espécie de Macrococcus canis isolada da pele e de locais infectados de cães nos levou a questionar se Macrococcus spp. são comuns em cães e resistentes a antibióticos. Hipótese/Objetivos Avaliar a ocorrência de Macrococcus spp. em cães, determinar seus perfis de resistência a antimicrobianos e suas relações genéticas. Animais Cento e sessenta e dois cães (West Highland White Terrier e Terra Nova, principalmente) foram testados para a presença de Macrococcus spp, incluindo seis cães com infecções por Macrococcus. Métodos As amostras foram coletadas da pele, condutos auditivos e mucosa oral utilizando swab. Macrococos foram identificados por espectrofotometria de massa por ionização e dessorção a laser assistida por matriz, sequenciamento do 16S rRNA e nuc‐PCR. Concentrações inibitórias mínimas de 19 antibióticos foram determinad

Weiterführende Literatur

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