Details

Autor(en) / Beteiligte

• Chen, Kai
• Lu, Zhike
• Wang, Xiao
• Fu, Ye
• Luo, Guan-Zheng
• Liu, Nian
• Han, Dali
• Dominissini, Dan
• Dai, Qing
• Pan, Tao
• He, Chuan

Titel

High-Resolution N6-Methyladenosine (m6A) Map Using Photo-Crosslinking-Assisted m6A Sequencing

Ist Teil von

• Angewandte Chemie, 2015-01, Vol.127 (5), p.1607-1610

Ort / Verlag

Weinheim: WILEY-VCH Verlag

Erscheinungsjahr

2015

Quelle

Alma/SFX Local Collection

Beschreibungen/Notizen

• N6‐methyladenosine (m6A) is an abundant internal modification in eukaryotic mRNA and plays regulatory roles in mRNA metabolism. However, methods to precisely locate the m6A modification remain limited. We present here a photo‐crosslinking‐assisted m6A sequencing strategy (PA‐m6A‐seq) to more accurately define sites with m6A modification. Using this strategy, we obtained a high‐resolution map of m6A in a human transcriptome. The map resembles the general distribution pattern observed previously, and reveals new m6A sites at base resolution. Our results provide insight into the relationship between the methylation regions and the binding sites of RNA‐binding proteins. Modifikationsstellen an N6‐Methyladenosin (m6A) können mit einer durch Photovernetzung vermittelten Sequenzierungsstrategie mit hoher Präzision bestimmt werden. Die Methode wurde zur Erstellung einer hochaufgelösten Karte von m6A in einem menschlichen Transkriptom verwendet. 4SU=4‐Thiouridin, IP=Immunpräzipitation.