Details

Autor(en) / Beteiligte

• 张云华 王强 刘静 张鹏飞 陈建群

Titel

豌豆蚜基因组P450基因家族的分析

Ist Teil von

• K'un ch'ung hsueh pao, 2010 (8), p.849-856

Erscheinungsjahr

2010

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Quelle

EZB Electronic Journals Library

Beschreibungen/Notizen

• 细胞色素P450在各种内源和外源物质代谢中起着非常重要的作用。利用豌豆蚜Acyrthosiphon pisum基因组mRNA和氨基酸数据库研究P450基因功能的进化规律。通过生物信息学方法对豌豆蚜全基因组P450进行分析,结果显示：在豌豆蚜基因组中发现69个P450基因,它们分别属于13个P450家族和18个亚家族,是一个典型的多基因家族。进一步将这些基因与豌豆蚜ESTs数据库进行了比对分析,其中39个候选基因有EST证据,证明了这些P450基因在转录水平的真实性。以氨基酸相似度大于60%为标准对豌豆蚜基因组中P450基因进行分组,69个P450基因中,除18个基因序列因差异太大,不能被归入任何一组,其余51个可归入10个组,其中8个组（包含47条序列）适合于正选择和基因转换分析。正选择和基因转换分析结果表明：仅有1个组（含9个基因）显著受到正选择压力作用,正选择概率大于95%的氨基酸位点分别是20T和27N,20T位于底物识别位点SRS1,27N位于D-helix;有3个组（包含8个基因）显示显著的基因转换事件。参与基因转换的基因均为CYP4家族成员,分别是CYP4C,CYP4G和CYP4V亚家族。参与基因转换的成员之间的蛋白相似度较高（70%～95%）,且XM_001944991与XM_001951794同存在于SCAFFOLD12542上,XM_001945510与XM_001944057同存在于SCAFFOLD7010上。这可能暗示豌豆蚜P450基因通过基因复制,然后通过基因转换使P450获得新的功能,以适应多变的生存环境。此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现。